סדירות תרופתית לאי ספיקת כליות כרונית ולמנגנון הבסיסי המבוסס על כריית נתונים, פרמקולוגיה רשתית ועגינה מולקולרית Ⅱ
Jan 04, 2023
2.6 בדיקת יעדי CRF על ידי חיפוש ב- GeneCards ובמאגרי מידע של OMIM להשגת יעדי CRF טיפוליים, קביעת ציון רלוונטיות גדול מ- או שווה ל-5 ומחיקת יעדים כפולים, הושגו סך של 795 יעדים.
איור 1 רשת איגודי תרופות בתנאי של תמיכה 60 וביטחון 0. 85
2.7 מיון מטרות נפוצות ובניית רשתות אינטראקציה 795 יעדי CRF ו-80 יעדי פעולה של מרכיבים פעילים בתרופה נסקרו עם תוכנת שפת R ותוכנית שפת Perl כדי לסנן מטרות נפוצות, סך של 37 הוכנסו לתוכנת Venny 2.1, וה- Wei שהתקבל ENTU ראה מוסף פרסום משופר
STRING שימש להזנת 37 יעדים נפוצים ואינטראקציות חלבון-חלבון (PPIs) נבנו במצב "ביטחון גבוה: 0.4", ראה חומר משלים לפרסום משופר. החל את הפלאגין count.R כדי לספור את 30 יעדי החלבון המובילים בתדירות ההתרחשות, ביניהם IL-6, VEGFA, Caspase-3, NOS3, HIF-1 וכו' מופיעים יותר בתדירות גבוהה.
2.8 בניית רשת ביו-מולקולרית באמצעות Cytoscape 3.7.1 בתרשים רשת רכיב פעיל-CRF-target PPI. ביניהם, אדום מייצג מחלה, סגול מייצג Xinfang 1, כחול מייצג את החומר הפעיל, וירוק מייצג את המטרה המשותפת של Xinfang 1 החומר הפעיל ו-CRF. ראה חומר נוסף לפרסום משופר.
2.9 ניתוח GO והקרנת מסלול ליבה ההיסטוגרמות ודיאגרמות הבועות שהתקבלו מהניתוח הפונקציונלי של GO של היעדים הנפוצים לעיל באמצעות תוכנת שפת R מוצגים בחומר המשלים של Enhanced Publication. התהליכים הביולוגיים כוללים בעיקר קישור לסטרואידים, פעילות קולטני הורמון סטרואידים, פעילות קולטנים גרעיניים, פעילות גורמי שעתוק וכו'. מוצע כי הנוסחה החדשה עשויה לטפל ב-CRF על ידי ויסות תהליכים ביולוגיים מורכבים מרובים. ניתוח של העשרת נתיב KEGG של המטרות של Xinfang 1, ההתפלגות העיקרית של 33 מטרות נפוצות
בשומנים ובטרשת עורקים, גורם שעתוק גרעיני-κB (NF-κB), קולטן דמוי אגרה (TLR), HIF-1 ומסלולים אחרים, זה מראה ש-Xinfang 1 מטפל סינרגטי ב-CRF על ידי פעולה במספר מסלולים.
2.10 עגינה מולקולרית אם אנרגיית הקישור קטנה או שווה ל--4 kJ·mol-1, זה אומר שלמולקולה יש יכולת קשירה טובה למטרה. ניתן לשלב היטב את חמשת המרכיבים העיקריים עם חלבון המטרה. ביניהם, לסטיגמסטרול יש את השילוב הטוב ביותר עם NOS3. התוצאות הראו כי 5 המרכיבים העיקריים הללו קיימו אינטראקציה עם יעד החלבון והיו יציבים לאחר הקישור. ראה טבלה 7.
2.10 עגינה מולקולרית אם אנרגיית הקישור קטנה או שווה ל--4 kJ·mol-1, זה אומר שלמולקולה יש יכולת קשירה טובה למטרה. ניתן לשלב היטב את חמשת המרכיבים העיקריים עם חלבון המטרה. ביניהם, לסטיגמסטרול יש את השילוב הטוב ביותר עם NOS3. התוצאות הראו כי 5 המרכיבים העיקריים הללו קיימו אינטראקציה עם יעד החלבון והיו יציבים לאחר הקישור. ראה טבלה 7.
2.11.1 השפעות על קריאטינין וחנקן אוריאה בסרום קריאטינין וחנקן אוריאה בסרום (Hitachi H7600 מנתח ביוכימי אוטומטי, ערכת בדיקת קריאטינין ואוריאה) בקבוצת המודל עלו באופן משמעותי בהשוואה לקבוצה הריקה (P<0.05), and the new formula 1 was given for treatment After treatment, serum creatinine and blood urea nitrogen were significantly lower than those in the model group (P<0.05). The results are shown in Table 8.
2.11.1 השפעות על קריאטינין וחנקן אוריאה בסרום קריאטינין וחנקן אוריאה בסרום (Hitachi H7600 מנתח ביוכימי אוטומטי, ערכת בדיקת קריאטינין ואוריאה) בקבוצת המודל עלו באופן משמעותי בהשוואה לקבוצה הריקה (P<0.05), and the new formula 1 was given for treatment After treatment, serum creatinine and blood urea nitrogen were significantly lower than those in the model group (P<0.05). The results are shown in Table 8.
2.11.2 השפעות על תוכן NO ו-NOS3 ברקמת כליהתכולת ה-NO ו-NOS3 בקבוצת המודלים הייתה נמוכה משמעותית מאלה שבקבוצה הרגילה (P<0.05). After treatment with the new recipe 1, the NO and NOS3 contents were significantly higher than those in the model group (P<0.05) . The results are shown in Table 9.
3 דיון
3.1 ניתוח כריית נתונים במחקר זה, נעשה שימוש במערכת העזר להורשה של הרפואה הסינית המסורתית לניתוח כללי התרופות של המנהל Wu Zhaodong בטיפול ב-CRF. באמצעות ניתוח אלגוריתם המתאם, התברר כי התרופות הנפוצות של מנהל Wu Zhaodong בטיפול ב-CRF כוללות אסטרגלוס, liuyuexue, smilax smilax, Atractylodes macrocephala מטוגן, עלוקה, Shiwei, angelica, eupatorium, achyranthes bidentata ו-alisma. בהתבסס על ניתוח כללי תרופות מרשם המבוססות על כללי איגוד, נמצא ששילובי התרופות הנפוצים הם: ① Smilax,Cistanche, ו-Junxue; ② אסטרגלוס,Cistanche, ו-Junxue; ③ סמילאקס,אסטרגלוס; שֶׁלֶג; ⑤ אסטרגלוס, Atractylodes macrocephala מטוגן; ⑥ Atractylodes macrocephala מוקפץ, Liuyuexue; המרשמים החדשים לטיפול ב-CRF המבוססים על מקבצים היררכיים של אנטרופיה כוללים: ①שקד מריר-אסטראגלוס-פעמון-דאנגגוי-סמיליקס-Atractylodes macrocephala מטוגן; שרביטן שרופה עלים שסק; ④Su stam-codonopsis-coptidis-heterophylla heterophylla; שִׁלשׁוּל; ⑦Scutellaria baicalensis-עלוקה-אדמונית אדומה שורש-עלי שסק-אדנופורה;
הבמאי Wu Zhaodong מאמין ש-CRF בעיקרמערב את הטחול והכליה, והפתוגנזה מתחלקת לחסר ועודף. דהתסמונת חוסר נגרמת בעיקר ממחסור בטחול ובכליות, והטיפול הוא להמריץ אתטחול וכליות. קידום רטיבות, הרמוניה של רשת ושחרור עכירות וכו'. Astragalus, Angelica ו-Atractylodes Rhizome משמשים בעיקר לחידוש צ'י ודם; עלוקה, eupatorium ו-achyranthes bidentata משמשים בעיקר כתרופות לקידום זרימת הדם והסרת קיפאון הדם; .
3.2 מנגנון פעולה פוטנציאלי של New Prescription 1 New Prescription 1 מורכב מאסטרגלוס, אנג'ליקה, Atractylodes macrocephala מטוגן, Smilax cocos, שקד מר ופעמון. במרשם, Astragalus membranaceus מתוק בטעמו ומעט חם באופיו, והוא שייך למרידיאן הטחול והריאות.
רטיבות והשפעות אחרות, זה יכול לרפא CRF Sanjiao Shishi [10], זה התרופה של המלוכה; אנג'ליקה מתוקה וחריפה, חמימה באופייה, חוזרת למרידיאן הלב, הכבד והטחול, בעלת תפקיד לקדם את זרימת הדם, והיא תרופת השר.
תאימות אסטרגלוס, אנג'ליקה, מונרך ושר, הזנת צ'י ודם, יכולה להפחית משמעותית את חלבון השתן, לעכב פיברוזיס בכליות ולהגביר את תכולת האריתרופויאטין [11]. Atractylodes macrocephala המוקפץ מתוק בטעמו, מר בטבעו וחם בטבעו. הוא שייך למרידיאן הטחול ולמרידיאן הקיבה. לווסת את המיקרו-אקולוגיה של המעי, לעכב אנדוטוקסין,
שחק אפקט אימונומודולטורי [13], וכתרופה משלימה. אסטרגלוס, אנג'ליקה, סיסטאנצ'י ואטרקטילודסmacrocephala הם השילובים העיקרייםלהזנת הטחול, הכליות והדם[14. Smilax tuckahoe מתוק וקליל בטעמו, שטוח באופיו ושייך למרידיאן הכבד והקיבה. סך הכל רפואה משלימה. שקד מר ו- Platycodon grandiflorum הם זוגות תרופות. שקד מר מדכא ויורד, Platycodon grandiflorum עולה ועולה. אחד עולה ואחד יורד, מחליק את תנועת הצ'י, מווסת תעלות מים, משתן והפחתת נפיחות וניקוי עכירות הליחה [16]. המנהל Wu Zhaodong מאמין כי בחולים עם CRF, העכירות והרעל אינם יורדים, והעלייה והירידה של תנועת הצ'י הקרביים נחסמת. שיטת "הרמת הסיר וחשיפה" משמשת פעמים רבות לשיקום תנועת הצ'י, אשר תורמת להפרשת עכירות מרושעת, קיפאון ורעלן.
על מנת לבחון את המנגנון הפוטנציאלי של מרשם 1 החדש בטיפול ב-CRF, בוצעו עוד חיזוי פרמקולוגיה ברשת, עגינה מולקולרית ואימות ניסיוני. התוצאות הראו ש-28 רכיבים ביו-אקטיביים של פורמולה 1 החדשה נבדקו, והרכיבים הפעילים העיקריים היו -sitosterol, stigmasterol, quercetin, isorhamna Su, kaempferol. בהתבסס על רשת האינטראקציות של החומר הפעיל-CRF-מטרה, התגלו יעדי מפתח כגון IL-6, VEGFA, Caspase-3, NOS3 ו-HIF-1. -סיטוסטרול יכול להפחית את רמות הכולסטרול הכוללות בסרום, ובכך לעכב נזק לכליות [17]. -סיטוסטרול יכול לעכב את קיטוב M1 של מקרופאגים, לשפר את קיטוב M2, להפחית את רמות ה-TNF-ו-IL-6, ולעכב TLR כדי לווסת חסינות [18]. Stigmasterol הוא סטרואיד טבעי המעכב מסלול LPS/TLR כדי לשפר תגובה דלקתית מערכתית [19], מסדיר את ציר TNF-/VEGFR, ומעכב אנגיוגנזה [20]. Isorhamnetin מעכב פיברוזיס על ידי עיכוב יצירת מטריקס חוץ תאי על ידי פעולה על מסלולי TGF- 1/Smad3 ו-TGF- 1/p38 MAPK [21]. Kaempferol יכול להפחית באופן משמעותי מתח חמצוני וחמצן שומנים על ידי עיכוב מסלול ASK1/MAPK [22]; מעכב שחרור של גורמים דלקתיים דרך מסלול האיתות NF-κB [23].
IL-6 משתתף בתהליך של דלקת חיסונית ופיברוזיס בכליות על ידי הפעלת JAK/STAT, Ras-Raf MAP ומסלולים אחרים בסביבת גלוקוז גבוהה[24]. VEGFA הוא תת-סוג של VEGF, והשילוב של VEGFA ו-VEGFR2 יכול להחמיר פיברוזיס אינטרסטיציאלי בכליות[25]. Caspase-3 מתווך את הביטוי של GSDME בתאי צינורית כליה CRF כדי לגרום לנמק משני ופיברוזיס [26]. קולטן לגורם גדילה אפידרמיס כלייתי יכול לתווך אוטופגיה של פודוציטים וחדירה דלקתית［27］
. NOS3 יכול להפחית את רמת ה-SOD, להפעיל השפעות נוגדות חמצון ואנטי דלקתיות[25]. ניסויים בבעלי חיים מצאו גם כי לאחר טיפול ב-New Formula 1, רמות NO ו-NOS3 היו גבוהות משמעותית מאלו של קבוצת המודלים, מה שמצביע על כך ש-New Formula 1 עשוי להפעיל השפעות נוגדות חמצון ואנטי דלקתיות על ידי פעולה על NOS3.
בשילוב עם מסד הנתונים של KEGG לניתוח ביאור מסלולים, נמצא שהמרכיבים הפעילים של Xinfang 1 עשויים לפעול על שומנים וטרשת עורקים, NF-κB, TLR, HIF-1 ומסלולים אחרים. ליפידים וטרשת עורקים הם הגורמים העיקריים ל-CRF בשילוב עם סיכון קרדיווסקולרי［28］; מסלול NF-κB מפעיל תגובה דלקתית ומשתתף בהתקדמות של CRF［29］; TLRמתווך תגובה חיסונית מולדת, מתווך דלקת ופגיעה בכליותופיברוזיס בכליות[30]; HIF-1 מסדיר את חישת החמצן הכלייתי, מה שמוביל להיפוקסיה כלייתית ופיברוזיס בין-סטיציאלי, שהוא המפתח לטיפול ב-CRF[31].
לסיכום, פורמולה 1 חדשה עשויה לפעול על IL-6, VEGFA, Caspase-3, NOS3, HIF-1 ומטרות אחרות באמצעות -sitosterol, stigmasterol, quercetin, isorhamnetin, kaempferol ורכיבים אחרים . לווסת שומנים וטרשת עורקים, NF-κB, TTLR, HIF-1 ומסלולים אחרים, ממלאים תפקידים מרובים
ניתן לטפל ב-CRF על ידי שילוב השפעות רגולטוריות במספר נקודות, במטרות מרובות, במספר מסלולים ובמספר קישורים. עגינה מולקולרית אישרה גם כי קיימת פעילות קישור חזקה בין המרכיבים לעיל לבין המטרה.
3.3 סיכום הטיפול של המנהל Wu Zhaodong ב-CRF מתמקד בעיקר בהזנת הטחול והכליות, הזנת צ'י ודם, שחרור תנועת הצ'י ושחרור עכירות מהצדדים. בהתבסס על פלטפורמת TCM Heritance Auxiliary System, מחקר זה ביצע מחקר כריית נתונים על כללי התרופות של המנהל Wu Zhaodong, והשיג ידע חדש ומידע חדש שלא התקבל מאיסוף מקרים רפואיים מסורתיים וממחקר סטטיסטי, וסיפק מידע שימושי עבור המנהל Wu. חפירה מעמיקה והורשה של Zhaodong של חוויית טיפול ב-CRF. מתייחס.
באמצעות פרמקולוגיה רשתית, נמצא כי השפעת Xinfang 1 בטיפול ב-CRF היא רב-מרכיבית ורב-מטרה, והיא מעורבת בעיקר בוויסות שומנים וטרשת עורקים, NF-κB, קולטנים דמויי Toll, HIF{{ 5}} ומסלולים אחרים לעיכוב התקדמות CRF. הנוסחה החדשה 1 נחקרה באופן תיאורטי וניסיוני
מנגנון הפעולה בטיפול ב-CRF מספק התייחסות חשובה לרפואה סינית מסורתית לטיפול ב-CRF. עם זאת, כללי המרשם, שילובי הליבה ומרשמים חדשים שהושגו על ידי יישום כללי אסוציאציה ומחקר אשכולות עדיין זקוקים לאימות קלינית נוספת.
