תַקצִיר:באמצעותCistanche Deserticolaטפיל שני צמחים מארחים (Haloxylon Ammodendron ו- Atriplex Canescens) כחומרי בדיקה, מחקר זה קבע את תכולת הפוליסכריד ב- C. deserticola ממארחים שונים בשיטת חומצה פנול-סולפורית. רצף וניתוח טרנסקריפטום של Haloxylon-Cistanche ו-עמותות Atriplex-Cistancheנערכו באמצעות פלטפורמת הרצף של Illumina NovaseQ 6000. המחקר התמקד בחקירת הבדלי טרנסקריפטום ב- C. deserticola ממארחים שונים, סינון גנים אנזימטיים מרכזיים המעורבים במטבוליזם של פוליסכריד, ואימות הגנים שנבחרו באמצעות אימות QRT-PCR. מחקר זה נועד לספק בסיס תיאורטי לבחינת צמחים מארחים חדשים ושיפור גנטי של C. deserticola. התוצאה הראתה שתכולת הפוליסכריד שנמצאה ב- Atriplex Quadriptera-C.Deserticola הייתה עדיפה על זה שנמצא ב- Haloxylon Ammodendron-C. Deserticola. באמצעות ניתוח השוואתי של טרנסקריפטום, הוקרנו 14089 גנים המובעים באופן דיפרנציאלי (DEGS) מהגבעולים הבשרניים של Atriplex Quadriptera-C. Deserticola ו- Haloxylon Ammodendron-C. Deserticola. התוצאות של ניתוח העשרה של KEGG חשפו כי DEGs אלה הועשרו בצורה בולטת ביותר בנתיבים הקשורים למטבוליזם של פחמימות, מטבוליזם של גלקטוז, חילוף החומרים של חומצות אמינו ומטבוליזם של חומצות שומן. יתרה מזאת, בסך הכל 26 מעלות הושגו מארבעה מסלולים הקשורים למטבוליזם של פוליסכריד, ביניהם רמות הביטוי של הגן הפרוקטוזידאז וגן -גלקטוזידאז בגן הלוקסילון Ammodendron -C. דזיריקולולה היו גבוהים משמעותית מאלו שב- Atriplex Quadriptera-C. Deserticola. רמות הביטוי של גן uDP-glucose dehydrogenase ו- mannose -1- גן phosphate guanylate transforase בגן Atriplex Quadriptera-C. דסיקולולה היו גבוהים משמעותית מאלו ב- Haloxylon Ammodendron-C. Deserticola, שעשוי להיות גני האנזים העיקריים לוויסות ההבדל של חילוף החומרים הפוליסכריד ב- C. deserticola.

מילות מפתח Cistanche Deserticola; רצף טרנסקריפטום; מארחים; ההבדל במטבוליזם של פוליסכריד

Cistanche Deserticola

 

Cistanche deserticola yc ma, המופץ בעיקר בגאנסו, שינג'יאנג, נינגקסיה ומונגוליה הפנימית, הוא עשב מרפא סיני מסורתי שנכלל לאחרונה ב"הומולוגי מרפא ומזון"קָטָלוֹג. יש לו יתרונות בריאותיים שונים, כגוןטון יאנג כליות, מזין מהות ודם, וקידום תנועות מעיים, מה שהופך אותו למופעל באופן נרחב ברפואה, שירותי בריאות ותעשיית המזון[1]. בגלל זהאופי הטרוטרופי, Cistanche Deserticolaטפיל צמחי מארח שונים, עםHaloxylon Ammodendronוהמוצג לאחרונהשיח חצי-אילגריןAtriplex Canescens(Pursh) Nutt.להיות המארחים העיקריים שלה.

פוליסכרידים הם החומרים הפעילים העיקריים בהערכתCistanche Deserticolaאֵיכוּת. בתנאי מארח שונים,הצטברות והרכב מטבולישֶׁלCISTANCHEפוליסכרידים משתנים באופן משמעותי [2]. מחקר רפואי הוכיח זאתCISTANCHEלפוליסכרידים ישנוגדי חמצון, נוירו-הגנה, ויסות חיסוני ומשפר זיכרוןהשפעות פרמקולוגיות, הקלות ביעילותמחלת אלצהיימר, מחלת פרקינסון ומחסור בטחול הנגרם על ידי דיכאון בכבד[3]. עם התקדמות במודרניתטכניקות מיצוי וטכנולוגיות ניתוח רב-ספקטרום,תוכן, קומפוזיציה ומאפיינים מבנייםשֶׁלCISTANCHEבהדרגה מבהירים פוליסכרידים בהדרגה, ומרחיבים את היישומים שלהם.

מבחינתמחקר ביולוגיה מולקולריתעַלCISTANCHEמינים, מחקרי רצף טרנסקריפטום התמקדו בעיקרCistanche TubulosaוכןHaloxylon-CISTANCHEמערכות מורכבות.לְדוּגמָה,Hou et al.[4] בוצערצף טרנסקריפטום באורך מלא ופרופיל ביטוי גניםשֶׁלCistanche TubulosaבאמצעותPacbio ו- bgiseq -500 טכנולוגיות RNA-Seq, זיהוי237,772 תמלילים ייחודייםוהקרנת גני אנזים מפתח המעורבים בביוסינתזה של פנילנואיד גליקוזידו באופן דומה,פנג ואח '.[5] נערךניתוחים טרנסקריפטיים ומטבולומייםשל האוסטוריה ורקמות סמוכות שלשורשי הלוקסילון וCISTANCHEגבעולים בשרניים, חושף את תפקיד המארח בהצטברותCISTANCHEמטבוליטים. המחקר שלהם הדגיש כיצמח מארח לא רק משפיע על התשואה שלCISTANCHEאבל גם האיכות שלהו עם זאת, מחקר עלCISTANCHEטפיל צמחי מארח שונים נותר מוגבל.

Atriplex Canescens, a צמח מושרש עמוק ועמיד בפני לחץ, שונה מהמסורתיתמארח הלוקסילוןומקורו במישור צחיח למחצה של מרכז ארצות הבריתו בשנים האחרונות הוא הוצג וקודם כ-מארח חדש עבורCistanche Deserticolaטיפוחבצפון -מערב סין. צ'ינג ואח '.[6] ניתח והשווה אתהצטברות פוליסכריד שלCISTANCHEטפילי חילוקסילון ו Atriplex Canescensבאותו אזור ייצור, ממצאהבדלים משמעותיים בתכולת הפוליסכרידבין שני תנאי המארח.

לפיכך, מחקר זה נועדרצף הגבעולים הבשרניים שלCistanche Deserticolaטפילי חילוקסילון ו Atriplex Canescens, ניתוחביטוי דיפרנציאלי של גני אנזים מפתח המעורבים בביוסינתזה של פוליסכרידו הממצאים יספקו אבסיס תיאורטי למחקר נוסף עלCISTANCHEמנגנוני ביוסינתזה של פוליסכריד, מעשירים מחקרים טרנסקריפטיים על Atriplex-CISTANCHEמערכות ומקדמות חדשנות באיכות גבוההCISTANCHEמשאבי גרעין.

 

חומרים ושיטות

1.1 חומרים ניסיוניים

Cistanche Deserticolaדוגמאות טפילהHaloxylon AmmodendronוכןAtriplex Canescensנאספו מה-CISTANCHEבסיס טיפוח בטאון Xiquan, מחוז ג'ינגטאי, מחוז גאנסו(רוֹחַב36 תואר 5 'n, קו אורך103 תואר 42 'ה). שְׁנֵיהֶםהלוקסילוןוכןAtriplex Canescensטופחו באותה סביבה. הדגימות סווגו כ-Haloxylon-CISTANCHE(מדגם א)וכןAtriplex-CISTANCHE(מדגם ח),עם שלושה משכפולים לכל קטגוריה (חמישה צמחים לכל שכפול). דגימה נערכה באפריל 2024והדגימות זוהו כ-Cistanche Deserticolaנורות בשרניות מאתפרופסור גואו יהונגמה-המכללה לחקלאות, האוניברסיטה החקלאית של גאנסו.

בעקבותהנחיות דגימה של Shanghai OE Biotech Co. בע"מ.,CISTANCHEגבעולים בשרניים נשטפו במים אולטרה -ערכיים, ועודף לחות הוסרה באמצעות נייר פילטר. פרוסות דקות נלקחו מה-למעלה, אמצע ותחתיתשל כל גבעול, מעורבב היטב ומכניסים לבקבוקונים קריוגניים. הדגימות היוקפוא במהירות בחנקן נוזליעֲבוּרשעתייםלפני שהועברו ל-80 מקפיא תוארלאחסון [7].

1.2 שיטות ניסוי

1.2.1 הקמת עקומה סטנדרטית וקביעת תוכן פוליסכריד

A 10 מ"גמדגם שלתקן D-glucoseנשקלו במדויק ונמסו ב100 מ"ל בקבוק נפחיעם מים מזוקקים להכנת א100 UG · ML⁻ פיתרון מלאיו פתרונות כיול של{{0}}. 2, 0. 4, 0. 6, 0. 7, 0. 8, ו- 0.9 מ"לשל תמיסת המניות הועברו לתוך10 מ"ל צינורות מבחן מפוקקים, מדולל במים ל1. 0 mlואז מעורבב עם1. 0 מ"ל של פתרון פנול של 6%וכן5 מ"ל של חומצה גופרתית מרוכזתו לאחר מערבולת, הפתרונות היו מחוממים באמבט מים רותחים עבור20 דקותואז התקרר באמבט מי קרח עבור10 דקות. A שליטה ריקההוכן באמצעות1. 0 מ"ל מים מזוקקיםבמקום תמיסת הגלוקוז. הספיגה נמדדה ב482 ננומטרבאמצעות אספקטרופוטומטר UV-Vis, ועקומה סטנדרטיתנוצר עםריכוז (x) כציר האופקיוכןספיגה (y) כציר האנכי.

בעקבות גישה שונה מLi Jie et al. [8], 0. 2 גרם מיובשCISTANCHEאֲבָקָהנשקלו במדויק והוכנסו לתוך א20 מ"ל צינור מבחן מפוקר. 10 מ"ל של 80% אתנולנוסף והתערובת הייתה נתונהמיצוי קולי של 80 מעלות (100 וואט, 40 קילו הרץ) למשך 30 דקותו התמצית סוננה כשהיא חמה והנוהל חזר על עצמו פעם אחת. לאחר ייבוש המשקעים,10 מ"ל מים מזוקקיםנוספה, ומיצוי קולי חזר על עצמו פעמיים. המסננים שולבו ומדוללים20 מ"לעם מים מזוקקים.1. 0 ml של פיתרון זההיה מדולל עוד יותר10 מ"לעם מים מזוקקים.

A 1. 0 ml aliquotשל המוכניםCISTANCHEתמיסת הדגימה נותחה באמצעות אותו נוהל כמו תקן הגלוקוז. הספיגה ב482 ננומטרנמדד, ותוכן הפוליסכריד שלCISTANCHEמחושב צמחים מארחים שונים חושב.

1.2.2 מיצוי RNA, בניית ספריית cDNA ורצף

סך ה- RNA חולץ מCistanche Deserticolaדוגמאות טפילהHaloxylon AmmodendronוכןAtriplex Canescensבאמצעותערכת RNA של Tiangen DP441 (סין), בעקבותפרוטוקול מגיב Trizolו טוהר ה- RNA הוערך באמצעות אNanodrop 2000 ספקטרופוטומטר (Thermo Scientific, USA), בעוד ריכוז ה- RNA ויושרה הוערכו באמצעות ANAgilent 2100 Bioanalyzer (Agilent Technologies, USA).

ספריות טרנסקריפטום נבנו באמצעותערכת הכנה של Vahts viversal V6 RNA-Seqו לאחר בקרת איכות עםAgilent 2100 Bioanalyzer, הספריות הוחלפו עלפלטפורמת Illumina NovaseQ 6000, לייצר150 BP קריאות מזווגות.

1.3 ניתוח נתונים

1.3.1 הרכבה של טרנסקריפטום והערה פונקציונלית

RAW קורא בפורמט FastQעובדו באמצעותטרמומטילהסרהPloy-N קוראים וקריאות באיכות נמוכה, וכתוצאה מכךקריאות נקייהו רצפי מתאם ואזורים באיכות נמוכה הוסרו, והקריאות הנקיות הורכבו לתוכוContigs(תגי רצף מבוטאים) באמצעותתוכנת טריניטיו התמליל הארוך ביותר מכל אשכול נבחר כ-יחידהלניתוח נוסף.

הערה פונקציונלית של יוניגנס בוצעה על ידי השוואה ביןמסד נתונים חלבוני NCBI שאינו מיותר (NR), שוויצרי-פרוט, וגנאלוגיה אבולוציונית של גנים: מסד נתונים אורתולוגי שאינו מפוקח (EGGNOG)באמצעותתוכנת Diamond (ערך אלקטרוני <1e -5). ביאור קבוצות אורתולוגיות אוקריוטיות (KOG)בוצע כדי לזהות גנים הומולוגיים. בנוסף, מיפוי יוניגניםאנציקלופדיה של קיוטו של גנים וגנום (KEGG)להערה על מסלול מטבולי.גנים אונטולוגיה (GO) סיווג והערה תפקודיתנערכו באמצעות מיפויים ממסד הנתונים של שוויץ-פרוט.

1.3.2 ניתוח ביטוי גנים וזיהוי של יוניגנים המובעים באופן דיפרנציאלי (DEGS)

רמות ביטוי הגנים כימותו באמצעותBowtie2כדי ליישר קריאות נקייה לאוניגנים. ערכי הביטוי חושבו כשברים לקילובאז של תמלול למיליון קריאות ממפות (FPKM)באמצעותתוכנה להביעו ניתוח ביטוי דיפרנציאלי בוצע באמצעותתוכנת DESEQ2, עםבדיקות התפלגות בינומית שלילית (NB)משמש לבדיקת משמעות. גנים שבאו לידי ביטוי באופן דיפרנציאלי הוגדרו כאלו עםq-Value <0. 05וכןשינוי קפל (fc)> 2.

1.3.3 אימות QRT-PCR של גנים המובעים באופן דיפרנציאלי

גני אנזים מרכזיים המעורבים בביוסינתזה של פוליסכרידעִםביטוי דיפרנציאלי משמעותינבחרו לאימות כמותי בזמן אמת (QRT-PCR)ו דגימות RNA נבדקו באיכות, וערכי OD נמדדו לפני שעתוק הפוך. סינתזת cDNA בוצעה באמצעות ה-Transscript All-in-One-Strand Synthesis Synthesis Supermix עבור ערכת QPCRו ה- cDNA המסונתז היה מדולל10- קפלו- QRT-PCR נערך באמצעות אמערכת QPCR פלורסנטיתבתנאי אופניים שונים.ACTB (בטא-אקטין) שימש כגן הפניה פנימיורמות ביטוי גנים יחסית חושבו באמצעותשיטת 2⁻ΔΔCT.

 

טבלה 1 רצפי פריימר

מזהה ג'ין	שם גנים	קדימה פריימר (5 '-3')	הפוך פריימר (5 '-3')
טריניטי _ dn 21412_ c 0_ g 1_ i 1_2	GMPP	Gatagtggctacaacatccactt	CCTCCTCTTCGTCGTAGGATTC
טריניטי _ dn 30174_ c 0_ g 1_ i 17_2	PFP	Tatatgggaccatggaaccaa	Gaccataggccgtgatcgatc
טריניטי _ dn 25715_ c 0_ g 2_ i 4_1	Ugdh	Aaagatcttccagttcgtaagc	Accaattcgttgatgctacc
טריניטי _ dn 28766_ c 1_ g 1_ i 6_1	לאץ	GTCTCCTTGTTATTCGTGAGGAT	GTCGATGGTGGTGAAGCAGAT
טריניטי _ dn 24102_ c 0_ g 6_ i 1_1	סאקה	TTACGAGATAGTGAGGTGCTA	AATGGAAGAGGAGGAGGTTGA
טריניטי _ dn 21508_ c 1_ g 2_ i 4_2	לאץ	GGCACAGTCAAGGAGTACGATG	Cactggcatcgacgagagaaag
-	ACTB	Caatggatgatgatatcgccgcgt	Cactggcatcgacgagagaaag

 

 

1.4 ניתוח נתונים

ניתוח אשכול היררכי שלגנים שבאו לידי ביטוי באופן דיפרנציאלי (DEGS)בוצע באמצעותR (v3.2.0)כדי לדמיין דפוסי ביטוי גנים בין קבוצות ודגימות. Go (Gene Ontology) ניתוח העשרה וKEGG (אנציקלופדיה של קיוטו של גנים וגנום) ניתוח העשרה מסלולנערכו באמצעותR, מבוסס עלהתפלגות היפרגומטריתו המונחים הפונקציונליים המועשרים באופן משמעותי הוצגו באמצעותתרשימי עמודות, חלקות בועה וחלקות מעגל העשרה.

2 תוצאות וניתוח

2.1 תוצאות קביעת תוכן פוליסכריד

משוואת הרגרסיה הליניארית שהתקבלה ממדידות הספיגה הייתה:

y {{0}}. 0 154x - 0.1636 (r 2=0. 9963) y {}}}. 0154x {8}}. 1636 \ Quad. (R^2=0. 9963) y =0. 0154x−0.1636 (r 2=0. 9963)

עם מגוון ליניארי של20–90 UG · ml⁻⁻ו שיעור ההתאוששות של הדיוק, החזרתיות, היציבות ושיעור התאוששות המדגם היו{{0}}. 38%, 0. 86%, 0.53%ו- 99.67%, בהתאמה.

הנמדדתוכן פוליסכרידבCistanche Deserticolaדוגמאות מצמחי מארח שונים היו:

Haloxylon-CISTANCHE: 6.51%

Atriplex-CISTANCHE: 11.83%

2.2 רצף טרנסקריפטום והרכבת נתונים

רצף טרנסקריפטום שלשש דוגמאותיצר בסך הכל41.77 גרם נתונים נקייםו הנתונים התקפים לדגימה נעו בין6.89 גרם עד 7.04 גרם, עםאחוזי בסיס Q30 בין 95.38% ל 95.91%, ותוכן GC ממוצע של 45.13%.

בסך הכל61,423 יוניגניםהורכבו, באורך מוחלט של65,962,858 BPואורך ממוצע של 1,073.91 bp.

2.3 הערה תפקודית גנים

בסך הכל61,423 יוניגניםהושגו מרצף שלCistanche Deserticolaדוגמאות לטפיל שני צמחי מארח שונים. תוצאות ההערה הן כדלקמן:

30,689 יוניגנים (49.96%)הוסברו במסד נתונים חלבוני NR (לא מיותר).

18,698 יוניגנים (30.44%)הוסברו במסד נתונים של שוויצרי-פרוט.

3,998 יוניגנים (6.51%)הוסברו במסד נתונים של KEGG.

17,188 יוניגנס (27.98%)הוסברו במסד נתונים של KOG (קבוצות אורתולוגיות אוקריוטיות).

25,280 יוניגנים (41.16%)הוסברו בEggnog (גנאלוגיה אבולוציונית של גנים: קבוצות אורתולוגיות שאינן מפוקחות).

16,210 יוניגנס (26.39%)הוסברו בGO (Gene Ontology) מסד נתונים.

16,153 יוניגנס (26.30%)הוסברו במסד נתונים של PFAM (משפחות חלבון).

בקרב אלה,21,650 יוניגניםהיו ארוכים מ1 KB.

ניתוח הומולוגיה המבוסס עלמסד נתונים NRחשף כי שלושת המינים הראשונים הקשורים ביותר היו:

Paulownia fortunei (30.23%)

Phtheirospermum japonicum (14.15%)

Chenopodium kinoa (7.1%)

 

 

טבלה 2 מידע על ביאור שלCistanche Deserticolaתפקוד גנים

מסד נתונים	מספר הגן ביאור	פרופורציה (%)
NR	30,689	49.96
פרוט שוויצרי	18,698	30.44
קג	3,998	6.51
קוג	17,188	27.98
ביצה	25,280	41.16
לָלֶכֶת	16,210	26.39

 

 

2.4 GO ו- KEGG ביאור וסיווג פונקציונלי

THEGO (Gene Ontology) מסד נתוניםשימש להערות נוספות של יוניגנים שזוהו במסד נתונים NR, וכתוצאה מכך בסך הכל16,210 יוניגניםו יוניגנים אלה סווגו לתוכושלוש קבוצות פונקציונליות עיקריות:

תהליך ביולוגי (BP)

פונקציה מולקולרית (MF)

רכיב סלולרי (CC)

בקטגוריית תהליך ביולוגי (BP), אשכולות יוניגנה השופעים ביותר היו:

"תהליך סלולרי" (11,023 יוניגנים)

"תהליך מטבולי" (9,117 יוניגנים)

עבורקטגוריית רכיב סלולרי (CC), 17 קטגוריות משנהזוהו, כאשר כל קטגוריית משנה מכילה לפחות30 יוניגנסו האשכולות הגדולים ביותר היו:

"תָא" (13,947 יוניגנים)

"חלק התא" (13,918 יוניגנים)

בקטגוריה של תפקוד מולקולרי (MF), הקבוצות הפונקציונליות המועשרות ביותר היו:

"כְּרִיכָה" (10,039 יוניגנים)

"פעילות קטליטית" (8,490 יוניגנים)

איור 2 עבור ביאור פונקציונלי וסיווג של יוניגנים

 

ביאור וסיווג פונקציונלי של KEGG

בְּמַהֲלָךרצף טרנסקריפטום, בסך הכל3,998 יוניגניםהוסברו בKEGG (קיוטו אנציקלופדיה של גנים וגנום)ו יוניגנים אלה סווגו לתוכושש קטגוריות ראשוניות, עם ספירת יחידותיהם והפרופורציות שלהם כדלקמן:

תהליכים סלולריים: 326 יוניגנס (8.15%)

עיבוד מידע סביבתי: 299 יוניגנס (7.47%)

עיבוד מידע גנטי: 1,771 יוניגנים (44.30%)

מחלות אנושיות: 14 יוניגנס (0.35%)

מֵטַבּוֹלִיזם: 1,465 יוניגנים (36.64%)

מערכות אורגניזם: 123 יוניגנס (3.07%)

שש הקטגוריות העיקריות הללו חולקו עוד יותר20 רמות סיווג משניותו ביניהם,עיבוד מידע גנטיהיה השיעור הגבוה ביותר, ואחריומֵטַבּוֹלִיזםו בתוךמֵטַבּוֹלִיזםקטגוריה, המסלולים השופעים ביותר היו:

מטבוליזם של פחמימות

מטבוליזם של חומצות שומן

חילוף חומרים פלבנואידי

איור 3 KEGG מסלול חילוף החומרים ביאור יוניגנים

 

2.5 ביטוי גנים דיפרנציאלי וניתוח העשרה שלCistanche Deserticolaממארחים שונים

נתוני רצף טרנסקריפטום סוננו באמצעותקריטריוני בחירת ביטוי דיפרנציאלי ברירת מחדלוכתוצאה מכך זיהוי של14,089 גנים המובעים באופן דיפרנציאלי (DEGS):

6,576 גנים הוסדרו מחדש

7,513 גנים הוסדרו למטה

A עלילת הר הגעשנוצר כדי לדמיין את ההתפלגות הכוללת של DEGs.

ב30 המובילים של העשרה סיווגים פונקציונלייםשל DEGS נצפה כי:

לְעוּמַתתהליך ביולוגי (BP)וכןרכיב סלולרי (CC)קטגוריות,פונקציה מולקולרית (MF)הציג העשרה משמעותית יותר של DEG.

ה- DEGs המועשרים ביותר היו קשורים ל-מטבוליזם של חומצות גרעין, חילוף חומרים חלבוני ואנזימים מרכזיים במטבוליזם גלקטוז.

בנוסף, DEG הועשרו באופן משמעותילמונחים הקשורים למטבוליזם של פוליסכריד, כולל:

תהליך מטבולי עמילן

תהליך ביוסינתטי של גליקוגן

תהליך קטבולי סוכרוז

פעילות גלוקוזידאז

פעילות UDP-L-Rhamnose Synthase

פעילות הידרולאז של פוליסכריד

איור 4 מפה וולקנית של גנים המובעים באופן דיפרנציאלי

 

ניתוח העשרה של מסלול Kegg של DEGs בCistanche Deserticolaממארחים שונים

לחקור עוד יותר אתגנים שבאו לידי ביטוי באופן דיפרנציאלי (DEGS)בCistanche Deserticolaמצמחי מארח שונים,ניתוח העשרת מסלול KEGGבוצע. הניתוח חשף כי:

DEGs מיפו ל 117 מסלולי חילוף חומרים.

THE20 הנתיבים המוביליםהראההעשרה משמעותית של DEG, עם המסלולים המועשרים ביותר כולל:

מטבוליזם של חומצות שומן

מטבוליזם של חומצה לינולנית

מטבוליזם של גלקטוז

השפלה של ליזין

ניתוח העשרה נוסף של20 הקטגוריות המטבוליות המובילות עם ערכי ה- Q הקטנים ביותרציין כי DEGs הועשרו באופן משמעותי ב:

מערכות אורגניזם

מֵטַבּוֹלִיזם

עיבוד מידע גנטי

בין הקטגוריות הללו,"מֵטַבּוֹלִיזם"היה המספר הגבוה ביותר של DEGs מועשר והראה את העשרה המשמעותית ביותר. בנוסף, במסלולי המטבוליים המועשרים,חלקם של יוניגנים המווסתים והמווסדרים המווסתים היה כמעט שווה.

ממצאים אלה מציעים זאתמסלולי מטבוליות ממלאים תפקיד מכריעבביטוי הגנים הדיפרנציאלי שלCistanche Deserticolaמצמחי מארח שונים, במיוחד במטבוליזם של שומנים, פחמימות וחומצות אמינו.