האגודה של מוטציה של מוטציה מינית של ATRX בחולות סרטן קיבה נשיות עם חסינות אנטי-סרטנית משופרת הקשורה לאימונותרפיה

תַקצִיר

רקע כללי:

שינויים גנטיים הוכחו כסמנים ביולוגיים מבטיחים לתגובת ICI. עם זאת, לעתים קרובות התעלמו מהטיות מיניות בשינויים גנטיים בתחום האימונותרפיה, מה שעשוי להשפיע במיוחד על חסינות אנטי סרטנית ויעילות אימונותרפיה בחולים גברים או נשים. כאן, הערכנו באופן שיטתי את ההשפעה של הטיות המין במוטציה סומטית של חולי סרטן קיבה (GC) על החסינות האנטי-סרטנית והתועלת הקלינית של אימונותרפיה.

מערכת החיסון היא מערכת חשובה לגוף האדם להתנגד לפלישה של מחלות. אם החסינות נמוכה, זה יוביל בקלות לירידה ביכולתו של הגוף להתנגד למחלות, ובכך יהפוך אותו לנטייה למחלות שונות.

לכן, חיזוק חסינות חשוב מאוד כדי לשמור על בריאות טובה. Cistanche הוא דבר שיכול לשפר חסינות בחיינו. Cistanche עשיר באכינאקוסיד וב-verbascoside, שניהם משפיעים על שיפור החסינות. Cistanche יכול לשפר את החסינות ולעזור לגוף להתנגד טוב יותר לפלישת חיידקים חיצוניים, ובכך לשפר את חסינות הגוף.

מוצר תוסף Click cistanche deserticola

שיטות:

נתונים גנומיים ותעתיקים של סרטן קיבה הורדו מ-The Cancer Genome Atlas (TCGA) ו-International Cancer Genome Consortium (ICGC). השגנו גם את הנתונים הגנומיים והקליניים של קבוצה שטופלה ב-MSKCC ICI ממסד הנתונים של cbioportal. פרופילי מוטציות סומטיות של גידולים שמקורם בגידול זכר ונקבה הושוו על ידי חבילת maftools R. ניתוח העשרה של מערך גנים מדגם בודד (ssGSEA) בוצע כדי לחשב את הניקוד של מדדי חסינות נגד סרטן, כולל איתות IFN, פעילות ציטוליטית (CYT) ומכונות מציגות אנטיגן (APM).

תוצאות:

נמצא כי ATRX עובר מוטציה בתדירות גבוהה יותר במטופלות GC נשים בהשוואה למטופלים גברים (FDR = 0.0108). מטופלות GC נשיות עם מוטציית ATRX הביאו לידי ביטוי משמעותית יותר תת-סוגים גבוהים ב-MSI, הגברת ביטוי TMB ו-PDL1 וכן ציונים גבוהים יותר של איתות IFN, CYT ו-APM. ניתוח העשרה של מערכי גנים (GSEA) הראה שמוטציית ATRX עשויה לשפר את האימונוגניות ואת חסינות אנטי סרטנית על ידי השפעה על מסלולי תיקון נזקי DNA.

בקבוצה שטופלה ב-ICI מ-MSKCC, חולי GC עם מוטציית ATRX היו קשורים להישרדות כוללת ממושכת. כאשר ריבדו את כל העוקבה שטופלה ב-ICI לפי מין, מטופלות עם מוטציית ATRX השיגו יתרונות הישרדות טובים יותר באופן משמעותי מזה של מטופלים גברים מוטנטיים ATRX (מטופלות נשים, HR של ATRX MT לעומת WT=0.636, 95% CI { {5}}.455–0.890, P=0.023; חולים גברים, HR של ATRX MT לעומת WT=0.929, 95 אחוז CI=0. 596–1.362, P=0.712).

מסקנות:

מוטציית ATRX עשויה לשמש כסמן ביולוגי פוטנציאלי לתועלת קלינית חיובית ל-ICI במטופלות GC. ניתן ליישם מוטציית ATRX בשילוב עם סמנים ביולוגיים אחרים של תגובת ICI כדי לזהות טוב יותר את מטופלות ה-GC אשר יפיקו תועלת רבה יותר מטיפול ICI.

מילות מפתח:

סרטן קיבה, הטיות מיניות, מוטציית ATRX, חסינות נגד סרטן.

רקע כללי

סרטן הקיבה (GC) הוא בעיה בריאותית עולמית מרכזית. בסין, GC הוא הסוג השני בשכיחותו של הגידול והיווה 291 מקרי מוות המיוחסים000 בשנת 2015 [1]. היעילות של אפשרויות הטיפול הנוכחיות עבור GC מתקדם מוגבלת, וההישרדות הכוללת של חולים אלה עדיין נמוכה. הפיתוח של אימונותרפיה גידולית, המיוצגת על ידי מעכבי נקודת ביקורת חיסונית (ICI), עיצבה מחדש את הטיפול בגידולים מוצקים ויעילות מוכחת בכמה מחלות ממאירות, כגון מלנומה, סרטן ריאות של תאים לא קטנים, קרצינומה של תאי כליה וקרצינומה חוזרת של תאי קשקש. ראש וצוואר [2–5].

למרות ש-ICIs הראו יעילות ראשונית מעודדת ב-GC מתקדם, התגובה הכוללת ל-ICI עשויה להיות לא יוצאת דופן כמו לאותם גידולים מוצקים כגון מלנומה וסרטן ריאות של תאים לא קטנים [6]. לפיכך, מחקרים נוספים של GC על פיתוח סמנים ביולוגיים מדויקים שיכולים לחזות את התגובה ל-ICI הם חובה.

מוטציות סומטיות ספציפיות, כגון מוטציית TET1, מוטציית NOTCH וכן חישוב TP53 ו-KRAS, הוכחו כסמנים ביולוגיים מבטיחים לתגובת ICI [7-9]. עם זאת, הטיות מיניות שמתעלמות מהן לעתים קרובות בתחום האימונותרפיה עשויות להתקיים בשינויים גנטיים ספציפיים. על ידי ביצוע השוואה של פרופילי מוטציות סומטיים בין גידולים המתרחשים בגברים ובנשים על פני מספר סוגי סרטן, Li et al. גילו כי קיימות הטיות מיניות גדולות בצפיפות ובתדירות המוטציות, אשר ישפיעו על ביצועי הסמן הביולוגי הפרוגנוסטי [10]. יתר על כן, מין יכול גם להשפיע על יעילות האימונותרפיה.

לדוגמה, Wu et al. דיווחו שטיפול ב-ICI מאריך את ההישרדות הכוללת וההישרדות ללא התקדמות של חולים גברים עם גידולים, במיוחד אלה שטופלו במעכבי CTLA-4 [11]. קונפורטי וחב'. ביצעו שתי מטא-אנליזות בהתאמה ומצאו שחולים גברים יכולים להפיק תועלת גדולה יותר מ-ICI בלבד מאשר מטופלות, בעוד שנשים משיגות יתרונות קליניים יותר מגברים מ-ICI בתוספת כימותרפיה [12, 13]. עדות זו מספקת השערה שייתכן שיש סמנים ביולוגיים מוטים-מיניים המתאימים יותר לחולים גברים או נשים.

לכן, ניסינו לחקור אם יש מוטציות גנים ספציפיות עם הטיות מיניות שישפיעו על יעילות האימונותרפיה עבור מטופלות GC נשים או גברים. במחקר זה, הערכנו באופן שיטתי את השונות המינית בפרופילי המוטציות הסומטיות של GC וגילינו שמוטציית ATRX המופיעה בשכיחות גבוהה יותר בקרב מטופלות GC נשיות קשורה עם TMB גבוה יותר, חסינות מוגברת נגד סרטן ותועלת קלינית חיובית ל-ICI.

שיטות

מקורות מידע

הורדנו את נתוני ה-RNA-seq ברמה 3 (n=375), את הנתונים הקליניים המתאימים (n=443), ואת פרופיל המוטציות הסומטיות (n=433) של חולי GC מ-TCGA. המטופלים ללא פרופילי ביטוי גנים, מידע על מין או נתוני מוטציות לא נכללו. פרופיל המוטציות הסומטיות של חולי GC סיניים ויפנים (פרויקט: GACA-CN, n=123; GACA-JP; n ​​= 585) ​​הורד גם ממערכי נתונים של ICGC. נתוני מצב MSI של חולי GC מ-TCGA התקבלו במחקר הקודם [14]. הנתונים הגנומיים וההישרדות של קבוצה שטופלה ב-ICI הורדו מ-Samstein et al. [15].

ניתוח מוטציות סומטיות

נתוני המוטציה הסומטיים נותחו על ידי חבילת maftools R [16]. פרופילי המוטציות בין חולי GC גברים ונשים הושוו באמצעות הפונקציה של mafComapre. בדקנו רק את הגנים שעברו מוטציה לפחות ב-5 דגימות באחת מהקבוצות. שיעור הגילוי הכוזב (FDR) של 0.05 נחשב כערך החיתוך למובהקות.

PolyPhen{{0}} (Polymorphism Phenotyping v2) הוא כלי תוכנה שיכול להעריך את ההסתברות לפגיעה במבנה החלבון שנגרם על ידי מוטציית ה-missense [17]. השתמשנו בתוכנת Polyphen-2 כדי להעריך עוד יותר את ההשפעה המוטציונית על מבנה החלבון. בהתבסס על הציון הסופי המעריך את השפעת מוטציית ה-missense על מבנה החלבון, ערך הסף של 0.69 נקבע לחלק את המוטציה ב-missense למוטציה שפירה ב-missense או מוטציית missense מזיקה.

כימות מוטציות גידול (TMB).

הווריאציות הסומטיות הנקראות שנקבעו על ידי TCGA ו-ICGC שימשו להערכת ה-TMB. גודלו של אזור האקסום הוגדר כ-38 מגה-ביט. המוטציה והווריאציות הנרדפות באזורים הבין-גניים או הלא-מקודדים לא נכללו בהערכת TMB. כפי שתואר במחקר הקודם [18], ציון ה-TMB של כל מדגם חושב כמספר הכולל של המוטציות שנספרו חלקי גודל אזור האקסום.

הערכת ציון הפעילות הציטוליטית (CYT).

נתוני ביטוי הגנים בפורמט FPKM שנאספו מ-TGCA הועברו לראשונה לתמלילים למיליון (TPM). ערכי ה-TPM הועברו אז ב-log2. ציון CYT תואר כממוצע הגיאומטרי של ערכי ביטוי GZMA ו-PRF1 ב-TPM [19].

הערכה של תאי חיסון חודרים לגידול עם CIBERSORT

CIBERSORT הוא כלי דה-קונבולוציה שיכול להעריך במדויק את השפע של תת-קבוצות של לויקוציטים אנושיים בביופסיה של גידול [20]. השתמשנו בשיטת CIBERSORT ובחתימת הגן LM22 (מטריצת חתימת גן לויקוציטים מאומתת המכילה 22 תת-קבוצות המטופואטיות אנושיות מוגדרות פונקציונלית) כדי להעריך את הפרופורציות של תאי חיסון ב-GC. בקריטריון של P < 0.05, התוצאות של הרכב תאי החיסון מ- CIBERSORT נחשבו למדוייקות.

ניתוח העשרה של סט גנים מדגם בודד (GSA)

השיטה של ​​ssGSEA מחשבת ציון העשרה של מערך גנים לכל דגימה על ידי השוואת דרגות הגנים ברשימת הגנים עם דרגות כל הגנים האחרים בתעתיק [21]. השתמשנו בגישה זו כדי להעריך באופן חישובי את מכונות האיתות של IFN והצגת אנטיגן (APM) [22, 23]. השתמשנו בחתימת APM של 7 גנים שהוגדרה בעבר שהורכבה מגנים מסוג MHC I וגנים המעורבים בעיבוד וטעינת אנטיגנים. איתות IFN- נמדד באמצעות ערכת הגנים משני ניסויים קליניים של GC מתקדם מ-KEYNOTE-012 [6] ו-KEYNOTE-059 [24]. השיטה של ​​ssGSEA יושמה בחבילת GSVA R [25]. רשימת הגנים הוצגה בקובץ נוסף 1.

ניתוח העשרה של סט גנים

ניתוח מערך גנים (GSEA) יושם על ידי אפליקציית javaGSEA (גרסה 4.0.3). נעשה שימוש ב-GSEA לזיהוי מסלולי המפתח הקשורים למצב המוטציה של ATRX. ערכות הגנים המוערות (c2.cp. Kegg.v7.1.symbols.gmt) עבור GSEA נבחרו כקבוצות הגנים הייחוס. FDR < 0.25 ו-P < 0.05 נחשבו כקריטריוני הסף.

ניתוח סטטיסטי

בדיקת Log-rank בניתוח קפלן-מאייר בוצעה כדי להעריך הבדלי הישרדות בין קבוצות. בדיקת Wilcox או Kruskal-Wallis עם תיקון Bonferroni פוסט-הוק בזוגיות שימשה להערכת ההבדלים בתתי קבוצות. מבחן הצ'י ריבוע או מבחן פישר המדויק יושם כדי להשוות את התפלגות המאפיינים הקליניים בין הקבוצות. ניתוחי רגרסיה של Cox חד משתנים ורב משתנים בוצעו כדי לזהות את הגורמים בעלי ערך פרוגנוסטי בלתי תלוי. P < 0.05 נבחרו כקריטריונים לחתוך.

כל הניתוחים הסטטיסטיים בוצעו עם תוכנת R (גרסה 3.6.2). הדמויות של עלילת הקופסה וההיסטוגרמה הופקו על ידי GraphPad Prism (גרסה 8.0.1).

תוצאות

וריאציות סומטיות בחולי GC גברים ונשים

השווינו תחילה את התדירות של מוטציות סומטיות מקבוצת TCGA בין מטופלות GC נשים וגברים. באופן מסקרן, נמצא כי רק מוטציית ATRX מתרחשת באופן משמעותי יותר בקרב מטופלות בהשוואה לגברים לאחר התאמת שיעור הגילוי השגוי (FDR=0.0108) (איור 1a).

כדי למנוע הטיה מקרית הנגרמת על ידי קבוצה בודדת, אימתנו עוד יותר את ההטיות המיניות של מוטציית ATRX בקבוצות של GACA-CN ו-GACA-JP. תדירות המוטציות של ATRX ב-GACA-CN ו-GACA-JP הייתה 31.7 אחוזים (39/123) ו-6.3 אחוזים (37/585) בהתאמה. הפרופורציות של מטופלות עם מוטציית ATRX ב-GACA-CN (נקבה 40.5 אחוז לעומת זכר 27.9 אחוז, בדיקת פישר מדויקת, P=0.206) ו-GACA-JP (נקבה 11.0 אחוזים לעומת גברים גברים 4.3 אחוזים, הבדיקה המדויקת של פישר, P=0.004) היו שניהם גבוהים מזה של חולים גברים (איור 1ב).

לאחר מכן, ניסינו לבחון האם ניתן למצוא פערי מין במוטציית ATRX בפרויקטים סרטניים אחרים של ICGC. לא כללנו את הגידולים המוגבלים במין ופרויקטים של סרטן עם תדירות מוטציות ATRX של פחות מ-5 אחוזים. באופן מדהים, מחצית מפרויקטי הסרטן (50 אחוזים, 17/34) הראו הבדלים מובהקים בין המינים במוטציית ATRX (איור 1c, קובץ נוסף 2). ברוב פרויקטי הסרטן (88.2 אחוזים, 30/34) תדירות המוטציות של ATRX הייתה גבוהה יותר בנשים מאשר בחולים גברים, למרות שההבדל בחלק מפרויקטי הסרטן לא הראה מובהקות סטטיסטית. בנוסף, הערכנו את ההשפעה הפוטנציאלית של מוטציית ATRX missense על מבנה החלבון על ידי תוכנת PolyPhen-2. מוטציות ה-missense המזיקות במטופלות היו דומיננטיות מבין כל מיני מוטציות ATRX בקוהורט TGCA (קובץ נוסף 3). בסך הכל, תוצאות אלו מצביעות על כך שמוטציית ATRX בחולי סרטן קיבה עשויה להתקיים הטיות מיניות.

מתאם בין מוטציית ATRX למאפיינים קליניים

השווינו תחילה את התפלגות המאפיינים הקליניים בין סוג המוטנטי ATRX לחולים מסוג פרא (טבלה 1). באופן מדהים, רוב החולים המוטנטיים של ATRX היו גידולים בעלי חוסר יציבות במיקרו-לווין (MSI-H) בהשוואה למטופלים מסוג ATRX (איור 2a). לאחר מכן המשכנו לבחון האם מוטציית ATRX יכולה להשפיע על ההישרדות הכוללת של חולי GC. בדיקת Log-rank באנליזה של Kaplan-Meier הראתה שחולים מוטנטיים ATRX נטו להישרדות כללית טובה יותר מאשר חולי פרא (איור 2b). ניתוח קפלן-מאייר של חולים מ-GACA-CN הראה גם תוצאה דומה (איור 2c).

יתרה מכך, כדי להעריך טוב יותר את יתרונות ההישרדות ממוטציית ATRX, חקרנו עוד את ההשפעה של מוטציית ATRX על תוצאות הפרוגנוזה בקבוצות שאינן GC במסד הנתונים של TCGA. בחרנו את קבוצות סרטן הלא-קיבה עם תדירות מוטציות ATRX של יותר מ-10 אחוז, כולל LGG (39.2 אחוז), UCEC (24.3 אחוז), SARC (16.9 אחוז), GBM (10.4 אחוז), CESC (10.4 אחוז), COAD (10.3 אחוזים). באופן דומה, מצאנו שמוטציית ATRX בחולים עם UCEC קשורה גם להישרדות כוללת ממושכת (קובץ נוסף 4). לבסוף, הערכנו את ההשפעה של מוטציית ATRX על ביטוי ATRX. מצאנו שלגידולים מוטנטיים ATRX היה ביטוי ATRX נמוך יותר, למרות שההבדל לא בא לידי ביטוי במובהקות סטטיסטית (איור 2ד). לסיכום, מוטציית ATRX הייתה בקורלציה מובהקת לתת-הסוג MHS-H והישרדות טובה יותר בחולי GC.

מוטציית ATRX קשורה לעומס מוגבר של מוטציות גידול וביטוי גבוה יותר של PDL1

נטל מוטציה של גידול (TMB) וביטוי PDL1 היו שני אינדיקטורים נפוצים לניבוי תגובה לאימונותרפיה. חישבנו את ה-TMB של כל חולה GC מ-TCGA, GACA-CN ו-GACA-JP בהתאמה. כפי שמוצג באיור 3a, TMB גבוה יותר נצפה בחולי GC מוטנטיים ATRX מהקבוצה של TCGA (חציון TMB 16.61 לעומת 2.526, P < 0.0001), GACA-CN (חציון TMB 1.974 לעומת 1.211, P=0.0001) ו-GACA-JP (חציון TMB 27.82 לעומת 2.421, P <0.0001). לאחר מכן השווינו את הביטוי של PDL1 בין חולי GC עם או בלי מוטציית ATRX בקבוצת TCGA. חולי מוטנט ATRX הכילו ביטוי גבוה יותר של PDL1 (ביטוי חציוני 2.027 לעומת 1.098, P=0.0244) מזה של חולי פרא (איור 3b).

בהתחשב בהבדלי המינים הפוטנציאליים במוטציית ATRX, אנו חוקרים עוד את המתאם של מוטציית ATRX עם ביטוי TMB ו- PDL1 המרובדים לפי מין (Sub1: חולות עם מוטציה ATRX; Sub2: חולות ללא מוטציה ATRX; Sub3: חולים גברים עם מוטציית ATRX; תת 4: חולים גברים ללא מוטציית ATRX). בקוהורטות של GACA-CN ו-GACA-JP, הן למטופלים והן לגברים עם מוטציית ATRX היה TMB גבוה יותר מאשר מטופלים מסוג ATRX (איור 3c). עם זאת, בקבוצות של TCGA, רק מטופלות מסוג ATRX מוטציה הראו TMB גבוה יותר מאשר מטופלים אחרים ללא מוטציה ATRX. אין הבדל משמעותי ב-TMB בין חולים גברים עם או בלי מוטציית ATRX. יתר על כן, בשלוש קבוצות לא נצפו הבדלים משמעותיים בין מטופלות ומטופלות עם מוטציית ATRX. כאשר השוו את ביטוי ה-PDL1 בין ארבע תת-הקבוצות בקבוצת TCGA, מצאנו שהביטוי של PDL1 במטופלות נשיות מוטנטיות ATRX היה גבוה יותר מאשר בחולים ללא מוטציית ATRX (איור 3ד).

באופן כללי, תוצאות אלו הצביעו על כך שחולים עם מוטציית ATRX, במיוחד חולות GC נשים, היו קשורות באופן משמעותי לביטוי גבוה יותר של TMB ו-PDL1.

מטופלות GC עם מוטציית ATRX מציגות חסינות מוגברת נגד סרטן

השתמשנו במספר גורמים מוכחים הקשורים לאימונותרפיה, כולל פעילות ציטוליטית (CYT) [26], איתות IFN [6], מכונות מציגות אנטיגן (APM) [27], ותאי חיסון חודרים לגידול [28], כדי לאפיין החסינות נגד סרטן. השתמשנו בשיטה של ​​ssGSEA כדי לחקור את הקשר של מוטציית ATRX עם חסינות אנטי סרטנית. למרות שהציונים של חסינות אנטי-סרטנית בחולים עם מוטציית ATRX היו גבוהים יותר מאלה של חולים ללא מוטציית ATRX, ההבדל לא הראה מובהק סטטיסטית (איור 4א).

עם זאת, כאשר העריכו את ההשפעה של מוטציית ATRX על חסינות אנטי-סרטנית מרובדת לפי מין, מצאנו כי מטופלות עם מוטציית ATRX הראו ציונים גבוהים יותר משמעותית של הגורמים הקשורים לאימונותרפיה מאשר מטופלים ללא מוטציית ATRX (איור 4ב). לא היו הבדלים מובהקים בציוני חסינות נגד סרטן בין מטופלי ATRX מוטנטיים וגברים פראיים. יתרה מזאת, מטופלות עם מוטציית ATRX הביעו ציונים גבוהים יותר של אינדיקטורים הקשורים לאימונותרפיה מאשר מטופלים גברים מוטנטיים ATRX.

לבסוף, השתמשנו בשיטת CIBERSORT כדי לחקור את הפרופורציות של תאי חיסון חודרים בקרב מטופלות נקבה מוטנטיות ATRX (Sub1), מטופלות נקבות פרא מסוג ATRX (Sub2), חולות זכר מוטנטיות ATRX (Sub3), וחולי פרא זכרים ATRX (Sub4). תאי עוזר פוליקולרי T, מקרופאגים M1 ותאים דנדריטים פעילים הועשרו באופן מובהק במטופלות עם מוטציית ATRX, בעוד שהפרופורציות של תאים דנדריטים במנוחה היו נמוכים משמעותית מאשר בחולים אחרים (איור 4c). תאי עוזר פוליקולרי T, מקרופאגים M1 ותאים דנדריטים פעילים קשורים למנגנון הצגת אנטיגן, מה שהיה עקבי עם ה-APM המוגבר במטופלות עם מוטציית ATRX.

לסיכום, מטופלות GC נשיות עם מוטציית ATRX הראו חסינות אנטי סרטנית חזקה יותר מחולי ATRX פרא או חולים זכרים מוטנטים. ההעשרה של תאי עוזר זקיקים מסוג T, מקרופאגים M1 ותאים דנדריטים פעילים בחולות נקבות מוטנטיות ATRX תמכה גם בתוצאה שלעיל.

ההשפעה של מוטציית ATRX על חסינות אנטי-סרטנית אצל מטופלות אינה מושפעת מהטרוגניות חיסונית מבוססת מין

כדי לבחון האם ההשפעה של מוטציית ATRX על חסינות אנטי-סרטנית בחולות נבעה מהטרוגניות חיסונית מבוססת מין, השווינו עוד יותר את גורמי החסינות האנטי-סרטניים לעיל בין חולות גברים ונשים. רק TMB הציג את ההבדלים בין המינים, ולמטופלות היה TMB גבוה יותר ממטופלים גברים (קובץ נוסף 5). עם זאת, ההבדלים ב-TMB בין נשים לגברים נעלמו כאשר לא כללנו את הדגימות הנשיות עם מוטציית ATRX (קובץ נוסף 5). תוצאות אלו גילו שהחסינות האנטי-סרטנית המוגברת בחולות מוטציות ATRX לא הושפעה מהטרוגניות חיסונית מבוססת מין.

ניתוח פרוגנוסטי עצמאי של מוטציית ATRX

תחילה ביצענו את ניתוח קפלן-מאייר כדי לקבוע את הערכים הפרוגנוסטיים של הגורמים הנ"ל הקשורים לאימונותרפיה. ביטוי ה-TMB וה-PDL1 חולק לקבוצות גבוהות ונמוכות בהתבסס על הכלי X-tile. כפי שמוצג באיור 5, הביטוי TMB ו- PDL1 השפיעו על הישרדותם של החולים. הקבוצה הגבוהה של TMB ו- PDL1 מרמזת על תוצאה טובה יותר. לאחר מכן כללנו ביטוי TMB ו- PDL1 בניתוח שלאחר מכן כדי לבחון את הערך הפרוגנוסטי העצמאי של מוטציית ATRX. ניתוחי רגרסיה של Cox חד משתנים ורב משתנים המחישו שמוטציית ATRX הייתה הגורם הפרוגנוסטי הבלתי תלוי (טבלה 2).

השפעת מוטציית ATRX על תיקון נזקי DNA

ביצענו GSEA כדי לנתח את ההקשר התפקודי של מוטציית ATRX. ניתוח מסלולי KEGG הראה שמוטציית ATRX הייתה מועשרת בעיקר בתיקון כריתת בסיס (BER), תיקון כריתת נוקלאוטידים (NER) ותיקון רקומבינציה הומולוגית (HRR) (איור 6א). התפקוד הביולוגי של מוטציית ATRX היה מעורב באופן משמעותי בתיקון נזקי DNA (DDR). לאחר מכן השתמשנו ב- ssGSEA כדי לאפיין את המסלול של BER, NER ו- HRR בין מוטנטי ATRX לחולים פראיים. כפי שמוצג באיור. 6b, BER (ציון חציוני 0.8734 לעומת 0.7909, P=0.{{10}} 002), NER (ציון חציוני 0.4333 לעומת 0.3605, P = 0.044), ו-HRR (ציון חציוני 0.7618 לעומת 0.6898, P = 0.0098) הועשרו באופן משמעותי במוטציה של ATRX חולים. יתר על כן, המשכנו לחקור את ההשפעה של מוטציית ATRX על מסלולי BER, NER ו- HRR המרובדים לפי מין. רק מטופלות עם מוטציית ATRX הביעו ציונים גבוהים יותר של BER, NER ו-HRR בהשוואה למטופלות אחרות ללא מוטציית ATRX (איור 6c).

יתרה מזאת, בחרנו בגנים הליבה המועשרים בשלושת המסלולים הללו כדי לבחון את הבדלי הביטוי בין מוטנטי ATRX לחולי פרא. מעניין שרוב הגנים הליבה באו לידי ביטוי גבוה בחולים מסוג ATRX מוטציה בהשוואה לזה של חולים מסוג פרא (איור 6ד). לאחר ריבוד מין, רמות הביטוי של גנים הליבה הקשורים ל-DDR היו גבוהות יותר גם בתת-קבוצות של נשים וגברים עם מוטציית ATRX מאשר שתי תת-קבוצות אחרות מסוג פרא (קובץ נוסף 6).

יחד, תוצאות אלו מרמזות על הפעלה משופרת של מסלולי DDR בחולים מוטנטיים ATRX. TMB גבוה יותר והפעלה של מערכת DDR עשויים להצביע על הסבירות למוטגנזה עזה והפעלת DDR מפצה מקבילה בחולים מוטנטיים ATRX.

מוטציית ATRX קשורה ליתרונות קליניים חיוביים ל-ICI

כדי לחקור אם מטופלים עם מוטציית ATRX יכולים להפיק תועלת מ-ICI, השגנו את הנתונים הגנומיים וההישרדות הזמינים לציבור של הקוהורט שטופל ב-MSKCC ב-ICI ממסד הנתונים של cbioportal [15]. הקוהורט שטופל ב-MSKC C ICI מכיל 1610 חולים מסוגי סרטן שונים עם נתוני מוטציות כולל 54 חולי סרטן קיבה. תדירות המוטציות של ATRX בחולי סרטן בצומת קיבה או גסטרו-ופק היא 7.41 אחוז (4/54). ראינו שלחולים עם מוטציית ATRX יש TMB גבוה יותר מאשר חולים מסוג ATRX (איור 7א). בחולים עם סרטן קיבה, חולי מוטציית ATRX נטו לכיוון של הישרדות כללית ארוכה יותר (חציון, לא הגיע לעומת 13 חודשים, P=0.194 ב-log-rank) (איור 7b).

באופן דומה, ההישרדות הכוללת של חולים עם מוטציית ATRX בכל העוקבה הייתה עדיפה גם על זו של חולי פרא ATRX (חציון, 30 חודשים לעומת 18 חודשים, P=0.075 ב-log-rank) ( איור 7ב). לאחר מכן חילקנו את כל הקוהורט לשתי קבוצות (נקבה וזכר) והשווינו את ההישרדות הכוללת בין מצב מוטציה של ATRX. מעניין לציין שרק מטופלות עם מוטציית ATRX השיגו הישרדות כוללת ממושכת משמעותית בהשוואה למטופלות מסוג פרא (חציון, 30 חודשים לעומת 14 חודשים, P=0.023 ב-log-rank) (איור 7c). יתר על כן, השווינו את כוח הניבוי של מוטציית ATRX בחולים גברים ונשים. HR של סוג מוטציה ATRX לעומת סוג פרא למטופלות (HR=0.636, 95% CI=0.455–0.890, P=0.023) טוב יותר מ-HR עבור חולים גברים (HR=0.929, 95 אחוז CI = 0.596–1.362, P=0.7117) (איור 7c).

יחד, נתונים אלה הצביעו על כך שמוטציית ATRX, במיוחד במטופלות, קשורה ליתרונות קליניים חיוביים לטיפול ב-ICI.

דִיוּן

במחקר זה, באמצעות השוואת פרופילי מוטציה סומטיים שמקורם בחולי GC גברים ונשים, זיהינו לראשונה שמוטציית ATRX התרחשה באופן מועדף בקרב מטופלות GC ונקשרה עם TMB גבוה יותר, חסינות מוגברת נגד סרטן ותועלת קלינית חיובית ל-ICI .

ATRX הוא גן מדכא גידולים ומקודד לחבר במשפחת החלבונים SWI/SNF. הוכח כי ATRX קשור לתיקון נזקי DNA [29], שמירה על יציבות גנטית [30], הקלה על שכפול DNA מתאים [31], ומשפיעה על ביטוי של גנים ספציפיים [32]. מוטציית ATRX מהווה את החריגות הגנטיות השכיחות בגליומות.

בגליומות מסוג IDH, הנוכחות של מוטציות ATRX שימשה כסמן חיובי להישרדות ארוכה יותר של החולה [33]. אובדן ATRX פגע בפעילות ההצטרפות הקצה הלא-הומולוגית והגביר את ה-MSI בגליובלסטומה, מה שגרם לרגישות גבוהה יותר לחומרים מזיקים ל-DNA [34]. האן ואחרים. דיווח כי ATRX יכול לווסת את תיקון נזקי ה-DNA על ידי אפנון מסלול ה-ATM והגברת הרגישות לטמוזולומיד בגליומה [35]. במחקר שלנו, TMB גבוה יותר והפעלה של מסלולי תיקון נזקי DNA נצפו במטופלות עם מוטציית ATRX. TMB נובע מהעימות בין מוטציה לתיקון DNA. תוצאות אלו הצביעו על כך שתפקוד תיקון נזקי DNA מפצה עשוי להיות חלש יותר ממוטגנזה חריפה יותר עם מוטציית ATRX. שיערנו שמוטציית ATRX בחולות GC נשיות עשויה להשפיע על תיקון נזקי ה-DNA הקשורים, מה שגורם ל-TMB הגבוה יותר ולחסינות מוגברת נגד סרטן. עם זאת, המנגנון המדויק של מוטציית ATRX בוויסות חסינות אנטי סרטנית בחולות GC נשים דורש מחקר נוסף.

חוקרים קיימים דיווחו על ההטיות המיניות של ATRX. יאנג וחב'. גילו כי עכברים נקבות חסרי ATRX בלבלב הראו באופן בלעדי רגישות מוגברת לפציעה ולפעולה האונקוגנית של KRAS שעבר מוטציה, בעוד עכברים זכרים ללא ATRX היו מוגנים [36]. באופן דומה, מצאנו גם כי מטופלות עם מוטציית ATRX הראו אימונוגניות מוגברת, במיוחד חסינות אנטי סרטנית חזקה יותר מאשר מטופלים גברים מוטנטיים ATRX, אשר עשויה להיות חלקית בגלל רגישות מוגברת לנזק ל-DNA בחולות נשיות מוטנטיות ATRX. Dunford et al. דיווחו שחלק מהגנים מדכאי הגידול (כולל ATRX) ב-chrX עלולים להימלט מאינאקטיבציה במהלך העובר, מה שיוביל לביטוי ביאללי של גנים אלה ולהגנה משופרת מסרטן אצל נקבות [37]. מחקר זה עשוי להסביר את התוצאה שלפיה אין ירידה משמעותית בביטוי ATRX במטופלות GC נשיות עם מוטציית ATRX, אם כי מוטציות קטיעה ו-missense מזיקות היו דומיננטיות בחולות נקבות מוטנטיות ATRX.

בנוסף להבדלים בין המינים באימונוגניות בין חולים גברים ונשים, פערי מין היו קיימים גם בביצועים של מוטציית ATRX בחיזוי ICI. למרות שהישרדות הכוללת ארוכה יותר נצפתה בחולים עם מוטציית ATRX שטופלו ב-ICI, כוח הניבוי של מוטציית ATRX היה טוב יותר עבור נשים מאשר גברים. מטופלות עם מוטציית ATRX רכשו יתרונות הישרדות גדולים משמעותית מטיפול ICI. וואנג וחב'. דיווחו גם על תוצאה דומה לפיה TMB הראה יכולת ניבוי טובה יותר בתגובת ICI עבור חולות NSCLC נשים מאשר חולות גברים [38]. פיתוח ויישום עתידיים של סמנים ביולוגיים של ICI צריכים לקחת בחשבון את ההבדלים בין המינים.

ישנן מספר מגבלות למחקר זה. ראשית, תדירות המוטציות הכוללת של ATRX בחולי GC נמוכה יחסית, במיוחד עבור חולי GC גברים. יתר על כן, השגנו את נתוני התעתיק רק מקבוצה אחת. מגבלות אלו עשויות להשפיע על עוצמת ההשוואה של חסינות אנטי סרטנית בין מטופלים לגברים. שנית, תדירות המוטציות של ATRX משתנה באוכלוסיות שונות.

במחקר שלנו, תדירות המוטציות של ATRX בשלוש קבוצות GC הייתה שונה (31.7 אחוזים בקבוצת GACA-CN, 6.3 אחוזים בקבוצת GACA-JP ו-5.3 אחוזים בקבוצת TCGA). יתר על כן, הפרופורציות של מטופלות עם מוטציית ATRX ב-GACA-CN (40.5 אחוזים) היו גבוהים בהרבה משתי העוקות האחרות (12.3 אחוזים בקבוצת ה-TCGA ו-11.0 אחוזים בקבוצת ה-GACA-JP) . ההבדל בתדירות מוטציות ATRX באוכלוסיות שונות עשוי להגביל איכשהו את השימוש במוטציית ATRX כסמן ביולוגי חיובי. שלישית, הניתוח שלנו הוכיח רק את הקשר של מוטציית ATRX עם TMB, חסינות אנטי סרטנית ויעילות הטיפול ב-ICI. המנגנון הפוטנציאלי של מוטציית ATRX בטיפול ICI במיוחד עבור חולים גברים עדיין זקוק לחקירה נוספת. לבסוף, עדיף להשוות את יתרונות ההישרדות ממוטציית ATRX בין נשים וגברים חולות GC לאחר טיפול ICIs, מה שיכול לאמת ישירות את ההבדלים בין המינים של מוטציית ATRX בחסינות אנטי-סרטנית הקשורה לאימונותרפיה. עם זאת, לא הצלחנו לבצע את ההשוואה בשל גודל המדגם המוגבל של חולי GC מוטנטיים ATRX בקבוצה שטופלה ב-MSKCC ICI.

לכן, ניסינו לחקור באופן ראשוני האם עשויים להיות הבדלים בין המינים ביתרונות ההישרדות ממוטציית ATRX על ידי השוואת ההבדלים בתוצאות הפרוגנוזה ממוטציית ATRX בין מטופלים וגברים על פני סוגי סרטן שונים בכל העוקבה. למרות שיתרונות הישרדות גדולים יותר מטיפול ב-ICIs נצפו במטופלות עם מוטציית ATRX על פני סוגי סרטן שונים, נתונים אלו עשויים להגזים במסקנה שהתקבלה עבור חולי GC. קבוצות נוספות שטופלו ב-ICI המכילות דגימות גדולות יותר של חולי GC מוטנטיים ATRX נדרשות כדי לאמת את ההבדלים בין המינים ביתרונות ההישרדות כאן.

מסקנות

לסיכום, המחקר שלנו מצא כי מוטציה מועדפת של ATRX בחולות GC נשיות קשורה לאימונוגניות מוגברת, חסינות מוגברת נגד סרטן ולתועלת קלינית חיובית ל-ICI. פערי המינים בתדירות המוטציות, חסינות אנטי סרטנית והיתרונות הקליניים הצביעו על כך שמוטציית ATRX עשויה להיות מתאימה יותר כמנבא פוטנציאלי לתועלת קלינית חיובית ל-ICI בחולות GC נשים. ניתן לשלב מוטציית ATRX עם סמנים ביולוגיים אחרים של תגובת ICI כדי לזהות טוב יותר את מטופלות ה-GC אשר יפיקו תועלת רבה יותר מאימונותרפיה. עם זאת, נדרש מחקר קליני נוסף כדי לאמת את התוצאות שלנו ולהעריך את הערך של מוטציית ATRX בחולים גברים.

קיצורי מילים

GC: סרטן קיבה; ICI: מעכבי נקודת ביקורת חיסונית; TCGA: אטלס הגנום הסרטני; ICGC: קונסורציום גנום הסרטן הבינלאומי; FDR: שיעור גילוי כוזב; TMB: נטל מוטציה של גידול; CYT: פעילות ציטוליטית; APM: מכונות להצגת אנטיגן; GSEA: ניתוח העשרה של סט גנים; ssGSEA: ניתוח העשרה של סט גנים מדגם בודד; MSI: חוסר יציבות של מיקרו-לווין; BER: תיקון כריתת בסיס; NER: תיקון כריתת נוקלאוטידים; HRR: תיקון רקומבינציה הומולוגית; DDR: תיקון נזקי DNA.

תודות

אנו מודים לפרויקטים של TCGA ו-ICGC על הפיכת הנתונים הגנומיים לזמינים לניתוח. אנו מודים גם לכותבים שסיפקו נתונים גנומיים והישרדותיים זמינים של העוקבה שטופלה ב-ICI במאגר cbioportal.

תרומות מחברים

תפיסה ועיצוב לימודים: YG ו-PMW. איסוף מערכי נתונים: YG, GPD, XSL, GQF ו-JJC. ניתוח ופרשנות נתונים: YG, FRW ו-WL. כתיבה, סקירה ועדכון של כתב היד: YG, FRW ו-PMW. הנחיית לימודים: PMW. כל המחברים קראו ואישרו את כתב היד הסופי.

מימון

עבודה זו נתמכה על ידי מדעי הרוח והחברה של הקרן לתכנון משרד החינוך של סין (מס' 16YJA840014).

הצהרות

אישור אתיקה והסכמה להשתתפות

מחקר זה התבסס על נתונים זמינים לציבור ממאגר TCGA, UCSC Xena ומאגר cbioportal, לא נדרשה אישור לביצוע מחקר זה. מחקר זה לא כלל דגימות אנושיות או שימוש במידע אישי מזהה. כל הנתונים ששימשו במחקר זה לא זוהו וזמינים לציבור, לא נדרש אישור אתי.

הסכמה לפרסום

לא ישים.

אינטרסים מתחרים

המחברים אינם מצהירים על ניגוד עניינים.

פרטי מחבר

1 המחלקה לאפידמיולוגיה וסטטיסטיקת בריאות, בית הספר לבריאות הציבור, אוניברסיטת דרום מזרח, 87 Dingjiaqiao Road, Nanjing 210009, Jiangsu, סין. 2 המחלקה להמטולוגיה ואונקולוגיה, בית החולים ג'ונגדה, בית הספר לרפואה, אוניברסיטת דרום מזרח, נאנג'ינג, סין. בית החולים האוניברסיטאי 3 דרום מזרח, נאנג'ינג, סין. 4 המחלקה של מרכז השתלות ריאות, בית החולים העממי של Wuxi של האוניברסיטה הרפואית נאנג'ינג, וושי, ג'יאנגסו, סין.

קיבלו:

26 באוקטובר 2020 התקבל: 25 בפברואר 2021.

הפניות

1. Zheng RS, Sun KX, Zhang SW, Zeng HM, Zou XN, Chen R, et al. דיווח על אפידמיולוגיה של סרטן בסין, 2015. Zhonghua Zhong Liu Za Zhi. 2019; 41(1):19–28.

2. Robert C, Schachter J, Long GV, Arance A, Grob JJ, Mortier L, et al. פמברוליזומאב לעומת איפילימומאב במלנומה מתקדמת. N Engl J Med. 2015;372(26):2521–32.

3. Garon EB, Rizvi NA, Hui R, Leighl N, Balmanoukian AS, Eder JP, et al. פמברוליזומאב לטיפול בסרטן ריאות לא תאים קטנים. N Engl J Med. 2015;372(21):2018–28.

4. Motzer RJ, Escudier B, McDermott DF, George S, Hammers HJ, Srinivas S, et al. Nivolumab לעומת Everolimus בקרצינומה מתקדמת של תאי כליה. N Engl J Med. 2015;373(19):1803–13.

5. Ferris RL, Blumenschein G Jr, Fayette J, Guigay J, Colevas AD, Licitra L, et al. Nivolumab עבור קרצינומה חוזרת של תאי קשקש בראש ובצוואר. N Engl J Med. 2016;375(19):1856–67.

6. Muro K, Chung HC, Shankaran V, Geva R, Catenacci D, Gupta S, et al. פמברוליזומאב למטופלים עם סרטן קיבה מתקדם PD-L1-חיובי (KEYNOTE-012): ניסוי רב-מרכזי, פתוח, שלב 1b. לנצט אונקול. 2016; יז(6):717–26.

7. Dong ZY, Zhong WZ, Zhang XC, Su J, Xie Z, Liu SY, et al. ערך ניבוי פוטנציאלי של סטטוס מוטציות TP53 ו-KRAS לתגובה לאימונותרפיה חסימת PD-1 באדנוקרצינומה של הריאה. Clin Cancer Res. 2017; 23(12):3012–24.

8. Wu HX, Chen YX, Wang ZX, Zhao Q, He MM, Wang YN, et al. שינוי ב-TET1 כסמן ביולוגי פוטנציאלי לחסימת נקודת ביקורת חיסונית במספר סוגי סרטן. J Immunother Cancer. 2019;7(1):264.

9. Zhang K, Hong X, Song Z, Xu Y. זיהוי של מוטציית NOTCH מזיקה כמנבא חדש לאימונותרפיה יעילה ב-NSCLC. Clin Cancer Res. 2020;26(14):3649–61.

10. Li CH, Haider S, Shiah YJ, Thai K, Boutros PC. הבדלים בין המינים בגנים מובילי סרטן ובסמנים ביולוגיים. Cancer Res. 2018;78(19):5527–37.

11. Wu Y, Ju Q, Jia K, Yu J, Shi H, Wu H, et al. מתאם בין מין ויעילות של מעכבי נקודת ביקורת חיסונית (מעכבי PD-1 ו-CTLA-4). Int J Cancer. 2018;143(1):45–51.

12. Conforti F, Pala L, Bagnardi V, De Pas T, Martinetti M, Viale G, et al. יעילות אימונותרפיה בסרטן ומין חולים: סקירה שיטתית ומטה-אנליזה. לנצט אונקול. 2018;19(6):737–46.

13. Conforti F, Pala L, Bagnardi V, Viale G, De Pas T, Pagan E, et al. הטרוגניות מבוססת מין בתגובה לאימונותרפיה של סרטן ריאות: סקירה שיטתית ומטה-אנליזה. J Natl Cancer Inst. 2019;111(8):772–81.

14. Liu Y, Sethi NS, Hinoue T, Schneider BG, Cherniack AD, Sanchez-Vega F, et al. ניתוח מולקולרי השוואתי של אדנוקרצינומות במערכת העיכול. תא סרטן. 2018;33(4):721–735.e728.

15. Samstein RM, Lee CH, Shoushtari AN. עומס מוטציות גידול מנבא הישרדות לאחר אימונותרפיה על פני מספר סוגי סרטן. נאט ג'נט. 2019; 51(2):202–6.

16. Mayakonda A, Lin DC, Assenov Y, Plass C, Koeffler HP. Maftools: ניתוח יעיל ומקיף של וריאנטים סומטיים בסרטן. Genome Res. 2018; 28(11):1747–56.

17. Adzhubei IA, Schmidt S, Peshkin L, Ramensky VE, Gerasimova A, Bork P, et al. שיטה ושרת לחיזוי מוטציות Missense מזיקות. שיטות נאט. 2010;7(4):248–9.

18. Chalmers ZR, Connelly CF, Fabrizio D, Gay L, Ali SM, Ennis R, et al. ניתוח של 100,000 גנומים של סרטן אנושי חושף את הנוף של עומס המוטציה של הגידול. Genome Med. 2017;9(1):34.

19. Narayanan S, Kawaguchi T, Yan L, Peng X, Qi Q, Takabe K. ציון פעילות ציטוליטית להערכת חסינות אנטי-סרטנית בסרטן המעי הגס. אן סורג אונקול. 2018;25(8):2323–31.

20. ניומן AM, Liu CL, Green MR. ספירה חזקה של תת-קבוצות תאים מפרופילי ביטוי רקמות. שיטות נאט. 2015;12(5):453–7.

21. Barbie DA, Tamayo P, Boehm JS, Kim SY, Moody SE, Dunn IF, et al. התערבות RNA שיטתית מגלה שסרטן אונקוגני המונע על ידי KRAS דורשים TBK1. טֶבַע. 2009;462(7269):108–12.

22. Şenbabaoğlu Y, Gejman RS, Winer AG, Liu M, Van Allen EM, de Velasco G, et al. אפיון מיקרו-סביבה חיסונית של גידול בקרצינומה של תאי כליה ברורים מזהה חתימות RNA שליח הרלוונטיות לפרוגנוסטיות ואימונותרפיות. גנום ביול. 2016;17(1):231.

23. Mandal R, Şenbabaoğlu Y, Desrichard A, Havel JJ, Dalin MG, Riaz N, et al. הנוף החיסוני של סרטן הראש והצוואר וההשלכות האימונותרפיות שלו. JCI Insight. 2016;1(17):e89829.

24. Fuchs CS, Doi T, Jang RW, Muro K, Satoh T, Machado M, et al. בטיחות ויעילות של Pembrolizumab Monotherapy בחולים עם סרטן קיבה מתקדם וסרטן צומת גסטרו-ושטי שטופלו בעבר: ניסוי KEYNOTE-059 קליני שלב 2. JAMA Oncol. 2018;4(5):e180013.

25. Hänzelmann S, Castelo R, Guinney J. GSVA: ניתוח וריאציות של סט גנים לנתונים של microarray ו-RNA-seq. BMC Bioinform. 2013;14:7.

26. רוני MS, Shukla SA, Wu CJ, Getz G, Hacohen N. תכונות מולקולריות וגנטיות של גידולים הקשורים לפעילות הציטוליטית החיסונית המקומית. תָא. 2015;160(1–2):48–61.

27. Zaretsky JM, Garcia-Diaz A, Shin DS, Escuin-Ordinas H, Hugo W, HuLieskovan S, et al. מוטציות הקשורות לעמידות נרכשת לחסימת PD-1 במלנומה. N Engl J Med. 2016;375(9):819–29.

28. Li B, Severson E, Pignon JC, Zhao H, Li T, Novak J, et al. ניתוחים מקיפים של חסינות הגידול: השלכות על אימונותרפיה בסרטן. גנום ביול. 2016;17(1):174.

29. Juhász S, Elbakry A, Mathes A, Löbrich M. ATRX מקדם סינתזה של תיקון DNA וחילופי כרומטידים אחים במהלך רקומבינציה הומולוגית. מול תא. 2018;71(1):11–24.e17.

30. Lovejoy CA, Li W, Reisenweber S, Thongthip S, Bruno J, de Lange T, et al. אובדן ATRX, חוסר יציבות גנום ותגובת נזק ל-DNA משתנה הם סימני ההיכר של התארכות חלופית של מסלול הטלומרים. PLoS Genet. 2012;8(7):e1002772.

31. Clynes D, Jelinska C, Xella B, Ayyub H, Taylor S, Mitson M, et al. תפקוד לקוי של ATRX גורם לפגמי שכפול בתאי עכבר ראשוניים. PLoS ONE. 2014;9(3):e92915. 32. Levy MA, Kernohan KD, Jiang Y, Bérubé NG. ATRX מקדם ביטוי גנים על ידי הקלה על התארכות תעתיק דרך אזורי קידוד עשירים בגואנין. הום ​​מול ג'נט. 2015;24(7):1824–35.

33. Pekmezci M, Rice T, Molinaro AM, Walsh KM, Decker PA, Hansen H, et al. גליומות מסתננות למבוגרים עם אבחנה משולבת של WHO 2016: תפקידים פרוגנוסטיים נוספים של ATRX ו-TERT. אקטה נורופתול. 2017;133(6):1001–16.

34. Koschmann C, Calinescu AA, Nunez FJ, Mackay A, Fazal-Salom J, Thomas D, et al. אובדן ATRX מקדם את צמיחת הגידול ופוגע בתיקון DNA מצטרף קצה לא הומולוגי בגליומה. Sci Transl Med. 2016;8(328):328ra328.

35. Han B, Cai J, Gao W, Meng X, Gao F, Wu P, et al. אובדן ATRX מדכא תיקון נזקי DNA תלוי ATM על ידי אפנון H3K9me3 כדי לשפר את הרגישות לטמוזולומיד בגליומה. סרטן Lett. 2018;419:280–90.

36. Young CC, Baker RM, Howlett CJ, Hryciw T, Herman JE, Higgs D, et al. אובדן ATRX מגביר את הרגישות לפגיעה בלבלב ול-KRAS אונקוגני בעכברים נקבות אך לא זכרים. Cell Mol Gastroenterol Hepatol. 2019; ז(1):93–113.

37. Dunford A, Weinstock DM, Savova V, Schumacher SE, Cleary JP, Yoda A, et al. גנים מדכאי גידולים הבורחים מ-X-inactivation תורמים להטיה מינית של סרטן. נאט ג'נט. 2017;49(1):10–6.

38. Wang S, Zhang J, He Z, Wu K, Liu XS. כוח הניבוי של עומס המוטציוני של הגידול בתגובת אימונותרפיה של סרטן ריאות מושפע ממין המטופלים. Int J Cancer. 2019;145(10):2840–9.

הערת המוציא לאור

Springer Nature נשאר ניטרלי לגבי תביעות שיפוט במפות שפורסמו ובשיוכים מוסדיים.

You Ge1, Feiran Wei2, Guoping Du3, Gaoqiang Fei1, Wei Li1, Xiaoshan Li4, Jinjin Chu1 ו-Pingmin Wei1*.

For more information:1950477648nn@gmail.com