הערכת הקשר בין חלבון תגובתי ברגישות גבוהה לתפקוד הכליות תוך שימוש באקראי מנדל במחקר J-MICC היפנית.

תַקצִיר

רקע: דלקת נחשבת אגורם סיכון למחלת כליות. עם זאת, האם מצב דלקתי הוא גורם או תוצאה שלמחלת כליות כרוניתנשאר שנוי במחלוקת. מטרתנו לחקור את הקשר הסיבתי ביניהםחלבון C תגובתי ברגישות גבוהה(hs-CRP) וקצב סינון גלומרולרי משוער(eGFR) באמצעות גישות רנדומיזציה מנדלית (MR).

שיטות:בסך הכל נותחו במחקר זה 10,521 משתתפים במחקר הקוהורט הרב-מוסדי ביפן. השתמשנו בגישות MR דו-דגימות (המשוקלל השונות ההפוכה (IVW), החציון המשוקלל (WM) ושיטת MR-Egger) כדי להעריך את ההשפעה של hs-CRP שנקבע גנטית על תפקוד הכליות. בחרנו ארבעה ושלושה פולימורפיזמים בודדים של נוקלאוטידים (SNP) הקשורים ל-hs-CRP כשני משתנים אינסטרומנטליים (IV): IVCRP ו-IVAsian, בהתבסס על SNPs שזוהו בעבר באוכלוסיות אירופאיות ואסיה. IVCRP ו-IVAsian הסבירו 3.4% ו-3.9% מהשונות ב-hs-CRP, בהתאמה.תוצאות:שימוש ב-IVCRP, hs-CRP שנקבע גנטית לא היה קשור באופן משמעותי עםeGFRבשיטות IVW ו-WM (הערכה לעלייה של יחידה אחת ב-ln(hs-CRP), 0.000; רווח בר-סמך של 95% [CI], −0.{{ 7}}19 עד 0.020 ו-0.003; 95% CI, -{{23 }}.019 עד 0.014, בהתאמה). עבור IVAsian, מצאנו תוצאות דומות באמצעות שיטות IVW ו-WM (הערכה, 0.005; 95% CI, −0.{{44} }20 עד 0.010 ו-0.004; 95% CI, -0.020 עד 0.012, בהתאמה). שיטת MR-Egger גם לא הראתה קשר סיבתי בין hs-CRP ל-eGFR (IVCRP: -0.008; 95% CI, -0.058 עד 0.042; IVAsian: 0.001; 95% CI, -0.036 עד 0.036).

מסקנות:ניתוחי ה-MR שלנו עם שתי דגימות עם IVs שונות לא תמכו בהשפעה סיבתית של hs-CRP על eGFR.

מילות מפתח: hs-CRP; eGFR; מחקר רנדומיזציה מנדליאנית;אפידמיולוגיה גנטית; דַלֶקֶת

לחץ כאן כדי לקבל תמצית CISTANCHE אורגנית טבעית עם 25% אכינאקוסיד ו-9% אקטוזיד לתפקוד הכליה

השירות התומך של Wecistanche - יצואנית ה-cistanche הגדולה בסין:

דוא"ל:wallence.suen@wecistanche.com

ווטסאפ/טלפון:+86 15292862950

קנה לפרטי מפרטים נוספים:

https://www.xjcistanche.com/cistanche-shop

מבוא

דלקת מערכתית נחשבת לאחת מהןגורמי סיכון למחלות כרוניות נפוצות, כוללסוכרת,1 יתר לחץ דם,2 מחלות לב וכלי דם,3 ומחלת כליות כרונית(CKD).4 באופן כללי,חלבון C-reactive(CRP) שימש כסמן ביולוגי של דלקת מערכתית במחקר קליני ובסיסי. למרות שמחקרי האורך הקודמים בחנו את הקשר בין רמות CRP ל-CKD באוכלוסיות שונות, העדויות לסיבתיות של קשר זה נותרו שנויות במחלוקת.5-7 עם זאת, כמה חוקרים הדגימו את ההשפעה של תפקודים ביולוגיים מוכווני CRP על תפקוד הכליות.8, 9 חוקר אחד גם פרסם מטה-אנליזה המצביעה על כך שתוספי ויטמין D יכולים להוריד את רמות ה-CRP במחזור הדם.10 ביחד, מחקרים אלו מצביעים על כך שהתערבויות ב-CRP עשויות לסייע בשיפור תפקוד הכליות.

בשנים האחרונות, הרנדומיזציה מנדליתגישת (MR) משכה תשומת לב רבה באפידמיולוגיה גנטית. היתרון הגדול ביותר של שיטה זו הוא לחקור קשר סיבתי בין חשיפה (X) לתוצאה (Y) ממערך תצפית באמצעות וריאנטים גנטיים כמשתנים אינסטרומנטליים (G: IV).11 התפתחות ניתוח MR התרחשה ברציפות לאחר מכן.זיהוי פולימורפיזם נוקלאוטיד בודד(SNP) במחקרי אסוציאציות ברחבי הגנום (GWAS). בדומה לתוצאות בריאותיות אחרות, GWAS קודמות זיהה SNPs הקשורים לרמות CRP, כולל הגן CRP בכרומוזום 1.12,13 מעניין, ידוע שרמות CRP בסרום מושפעות מפולימורפיזמים גנטיים,14 מה שמצביע על כך ש-SNPs הקשורים לרמות CRP עשויים לשקף החשיפה הממושכת לרמת= CRP נמוכה יותר. לכן, SNPs הקשורים לרמות CRP בסרום מתאימים ל-IV כדי לחקור את הקשרים הסיבתיים בין CRP למספר מצבים פתופיזיולוגיים, והשתמשו בהם במחקרי MR קודמים בקרב מבוגרים במדינות אירופה.15-17

במדינות אסיה, מחקרי עוקבה בקנה מידה גדול אספו גנומים אנושיים וביצעו גנוטיפ בעשורים האחרונים. מספר חוקרים ערכו GWAS ומצאו לוקוסים חדשים הקשורים לרמות CRP באוכלוסיות אסייתיות.18-20 מחקרים אלו מאפשרים לחוקרים לבצע מחקרי MR באמצעות SNPs הקשורים ל-CRP באוכלוסיות אסייתיות, מה שנראה חשוב מבחינת הבדלים אתניים. לכן, חקרנו האם רמות hs-CRP שנקבעו גנטית באמצעות שני IVs שונים, המבוססים על SNPs שזוהו באוכלוסיות אירופה ואסיה, היו קשורות סיבתיתפקוד כליותבאוכלוסייה יפנית המשתמשת בגישות MR.

שיטות

מקצועות לימוד

The study subjects were participants of the Japan Multi-institutional Collaborative Cohort (J-MICC) Study which was conducted in 14 study areas throughout Japan. The purpose of the J-MICC study was to find out the risk factors of cancer and other diseases by examining the relationship between genetic variants, lifestyle habits, blood components, and disease. The eligibility for the J-MICC Study was adults aged 35–69 years living in each study area. The details of the J-MICC Study have been described previously elsewhere and the latest information is available on its website (http:==www.jmicc.com).21,22 The selection process of participants is shown in Figure 1. From the genotyped 14,539 subjects, 26 samples with inconsistent sex information between the questionnaire and an estimate from genotype were excluded. The identity-by-descent method implemented in the PLINK 1.9 software (https:==www.cog-genomics.org=plink2) identified 388 relative pairs (pi-hat >0.1875) and one sample of each pair was excluded. Principal component analysis with a 1,000 Genomes reference panel (phase 3) (http:==www. international genome.org= category=phase-3=) detected 34 subjects whose estimated ancestries were outliers from the Japanese population. The 34 samples were excluded. Among all the remaining 14,091 samples, five subjects withdrew their consent to participate, leaving 14,086 subjects for the final analyses. Of these, the values of serum hs-CRP were available only at three study sites. Therefore, we decided to use a two-sample MR study design, rather than a single sample MR for a smaller dataset. We divided the participants into two groups; 1) 2,503 participants (available for hs-CRP) and 2) 12,501 participants (non-overlapping participants), which are by a basic principle of two-sample MR (nonoverlapping populations with the same ethnicity, similar sex, and age distribution).23 After excluding participants who had an extremely high value for hs-CRP (hs-CRP >3.0 mg=dL, n = 828) and eGFR (eGFR >120 מ"ל=דקה=1.73 מ"ר, n=3,647), ונמוך מגבול הכימות עבור hs-CRP (n=8), סה"כ 10,521 יפנים (1,667 עבור קשר גנטי עם hs-CRP [הנקרא כ-CRP מערך נתונים] ו-8,854 עבור קשר גנטי עם eGFR [נקרא כ-eGFR dataset]) נותחו ב-MR של שתי דגימות של מחקר זה. הסכמה מדעת בכתב התקבלה מכל המשתתפים במחקר זה. מחקר J-MICC נערך תוך הקפדה על ההנחיות האתיות לחקר הגנום האנושי ורצף גנטי. ההליך של מחקר זה אושר על ידי הוועדה לביקורת אתיקה של בית הספר לרפואה של אוניברסיטת נאגויה (939-14), מרכז הסרטן של איצ'י וכל מכוני המחקר. ביצענו ניתוחים באמצעות מערך הנתונים של גרסה 20190728.

מדידה של hs-CRP ו-eGFR

דגימות סרום נאספו מכל המשתתפים. מדדנו hs-CRP באמצעות נפלומטריה משופרת לטקס. קריאטינין בסרום נמדד בשיטה אנזימטית. כמה מכונים מדדו קריאטינין בסרום בשיטת Jaffe ולאחר מכן הפכו אותו לערך המקביל של השיטה האנזימטית. eGFR חושב באמצעות המשוואה היפנית שהוצעה על ידי האגודה היפנית לנפרולוגיה: eGFR (mL= min=1.73 m2)=194 × קריאטינין בסרום (mg=dL) −1.{{10}}94 × גיל–0.287 (× 0.739 לנשים).24

בחירת משתנים אינסטרומנטליים

רשימת ה-SNPs המועמדים ל-IVs מוצגת בטבלה 1. ראשית, בחרנו ארבעה SNPs (rs3093077, rs1205, rs1130864 ו-rs1800947) בתוך הגן CRP ששימש כ-IVs במחקרי MR קודמים.15 במחקר זה, SNPs אלה נבחרו כתת-קבוצה מינימלית להשגת גיוון בגן CRP באוכלוסיות אירופאיות ונקראו IVCRP. לאחר מכן, שקלנו שיש צורך לבחור SNPs ולפתח IVs מקורי באוכלוסייה אסייתית מכיוון שה-IVCRP פותח על סמך SNPs שזוהו באנשים ממוצא אירופי. לכן, חיפשנו את המילה 'CRP' בקטלוג GWAS (https:==www.ebi.ac.uk= gwas=), וצמצמנו למחקרים לפי הקריטריונים הבאים: 1) מחקר שנערך באוכלוסייה אסייתית, ו-2) מחקר עם שלב הגילוי והשכפול כאחד. לאחר הבחירה מבוססת האינטרנט, בחרנו לבסוף 13 SNPs. עבור 151233628, עקב איכות זקיפה נמוכה (MAF<0.05 and r2 < 0.3), this SNP was not included in the original J-MICC dataset. Of the remaining 12 SNPs, 6 SNPs (rs12133641, rs9375813, rs2097677, rs79802086, rs2393791, and rs1169284) were excluded because these SNPs were not significantly associated with hs-CRP in our dataset (P > 0.0042 = 0.05=12). Next, rs814295 (GCKR) and rs429358 (APOE) were likely to have pleiotropic effects on kidney function. rs3093059 was excluded due to the high linkage disequilibrium (LD) with rs3093068 in the CRP dataset (r2 > 0.9). Finally, three SNPs (rs30933068, rs7553007, and rs7310409) were included in our analysis and were called as IVAsian (Table 2).

ניתוח סטטיסטי

To confirm the cross-sectional association between hs-CRP and eGFR, multiple linear regression analysis was performed with adjustments for sex, age, and study sites. We performed two-sample MR approaches after dividing the participants into two datasets (CRP and eGFR datasets) as described above. Methods for two-sample MR were different from the one-sample MR method, which was described in previous methodological papers.25–27 The inversevariance weighted method (IVW) is a conventional approach to estimating a causal effect on a study outcome from different studies in meta-analysis.25 In the setting of MR analysis, the IVW method can provide a combined estimate weighted using the inverse variances of the causal effect of per-allele. However, this method can be biased when a genetic variant violates the assumptions of MR (eg, pleiotropic effect).27 Therefore, we also performed two other methods (the weighted median (WM) and the MR-Egger method) which can provide consistent estimates even under the weaker assumption.25 The MR-Egger analysis is also useful to detect either both directional pleiotropy or violation of the Instrument Strength Independent of Direct Effect (InSIDE) assumption. Additionally, the F-statistic was calculated for each IV from linear regression analyses to test whether IVs are strongly associated with exposure (referred to as relevance assumption).28 We performed linear regression analyses using the lm function in R and included all SNPs used in each IV in models. An arbitrary threshold of F-statistic >10 שימש כדי להימנע משימוש במכשירים גנטיים חלשים במחקר זה.29 כל הניתוחים הסטטיסטיים בוצעו באמצעות תוכנת R גרסה 3.5.0 (R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria). בפרט, חבילת R של "MendelianRandomization" שימשה לניתוחי MR דו-דגמים.30