ניסוי מוצלב כפול סמיות אקראי לחקר ההשפעות של פרביוטיקה עמילן עמיד על מחלת כליות כרונית (ReSPECKD) חלק 2
May 26, 2023
ועדת מעקב בטיחות
ההתערבויות בניסוי זה הן בסיכון נמוך, והן מתווספות לטיפול הסטנדרטי שהמשתתפים ימשיכו לקבל לאורך כל תקופת הניסוי ולאחר סיום הניסוי; לכן, לא יווצר לוח ניטור נתונים ובטיחות (DSMB). עם זאת, תהיה סקירה חיצונית של הכימיה הקלינית של המשתתף ושל כל תופעות לוואי של הניסוי באמצע הניסוי כאשר כל המשתתפים יסיימו את תקופת הטיפול הראשונה שלהם. סקירה זו תיערך על ידי נפרולוג מחוץ למניטובה. סקירה זו תעקוב אחר ראיות לנזק בטיפול, מחפשת מגמות בכימיה הקלינית ו/או עליות באירועים בלתי צפויים, הקשורים לטיפולים ותנקוט פעולה מתאימה. פעולות אלו עשויות לכלול הצעת שינויים בפרוטוקול, והן עשויות לכלול עצירה מוקדמת של הניסוי עקב נזק ברור של טיפול בהתאם לתוצאות הסקירה.
על פי מחקרים רלוונטיים, Cistanche הוא עשב סיני מסורתי ששימש במשך מאות שנים לטיפול במחלות שונות. הוכח מדעית שהוא בעל תכונות אנטי דלקתיות, אנטי אייג'ינג ונוגדי חמצון. מחקרים הראו כי cistanche מועיל לחולים הסובלים ממחלת כליות. החומרים הפעילים של cistanche ידועים כמפחיתים דלקת, משפרים את תפקוד הכליות ומשחזרים תאי כליה לקויים. לפיכך, שילוב cistanche בתוך תוכנית טיפול במחלת כליות יכולה להציע יתרונות גדולים לחולים בניהול מצבם. Cistanche עוזר להפחית פרוטאינוריה, מוריד את רמות ה-BUN והקריאטינין, ומפחית את הסיכון לנזק נוסף לכליות. בנוסף, cistanche גם מסייע בהפחתת רמות הכולסטרול והטריגליצרידים שעלולים להיות מסוכנים לחולים הסובלים ממחלת כליות.

לחץ על יתרונות rou cong rong
【למידע נוסף: david.deng@wecistanche.com / WhatApp:86 13632399501】
ניתוח סטטיסטי
הביואינפורמטיקה והניתוחים הסטטיסטיים של נתוני המיקרוביום יבוצעו בסיוע Microbiome Insights ופלטפורמת Data Science ב-CHI; הוא יעודכן בהתבסס על ההמלצות וההתקדמות הטכנולוגית מעכשיו ועד לעיבוד הדגימות. באופן כללי, הגדרות ברירת המחדל של ה-FLASH assembler [22] ישמשו למיזוג הקבצים המהירים של Illumina עם קצה מזווג. אלגוריתם UPARSE [23] ישמש עבור (א) סינון איכות של הקריאות בהתבסס על ערך השגיאה המקסימלי הצפוי=1.0, (ב) זיהוי של רצפים ייחודיים, (ג) מיון שפע ו הסרה של יחידות בודדות, (ד) קיבוץ הקריאות ליחידות טקסונומיות תפעוליות (OTUs) המבוססות על סף זהות של 97 אחוז, (ה) בדיקת כימרה דה נובו ומבוססת הפניות (נגד מסד נתונים GOLD [22]), ו-(ו) בנייה של שולחן OTU. הסיווג הטקסונומי יתבצע לאחר מכן באמצעות יישום QIIME [26] של UCLUST [24] ויהיה מיושר מול מסד הנתונים של Greengenes באמצעות אלגוריתם PyNAST [25]. עצים פילוגנטיים נבנו עם FastTree [27] לצורך השוואה נוספת בין קהילות חיידקים. לפני ביצוע ניתוחים במורד הזרם, טבלת ה-OTU המתקבלת תסונן כדי להסיר את כל הדגימות עם עומקי רצף נמוך. מדדי עושר וגיוון בקהילה יחושבו לאחר מכן באמצעות QIIME בעומק אחיד נתון לכל מדגם. מדדי גיוון פילוגנטיים (מרחקי UniFrac משוקלל) ומבוססים על שפע (שונות בריי-קרטיס) - יחושבו בעקבות נורמליזציה של טבלת ה-OTU הסופית תוך שימוש בטרנספורמציה של קנה מידה מצטבר (CSS) [28]. ניתוח קואורדינטות עיקרי (PCoA) יוחל על מטריצות המרחק שיתקבלו כדי ליצור גרפים דו מימדיים באמצעות הגדרות ברירת המחדל של תוכנת PRIMER-6 (PRIMER-E Ltd, Plymouth). ניתוח אשכולות ללא פיקוח יבוצע כדי לקשר בין דפוסי אשכולות של דגימות לשיעור ה-OTUs הליבה בתוך כל נישה (-OTUs הליבה מוגדרים כאלה הקיימים בלפחות 75 אחוז מהדגימות בכל נישה). השפע היחסי של ה-OTU שנבחר ינורמלו על פני דגימות. הבדלי בריי-קרטיס יחושבו באמצעות החבילה R "טבעונית" [29], והמטריצה שתתקבל תהיה נתונה לאשכולות היררכית ללא פיקוח באמצעות החבילה R "dendextend" [30] ותוצג על פני מפת חום של מטריצת שפע באמצעות חבילת R "complex-heatmap" [31]. נוהל UNIVARIATE של SAS ישמש לבדיקת תקינותם של שאריות עבור מדידות שונות. נתונים שאינם מבוזרים נורמליים יועברו ל-Log או Box-Cox כוח ולאחר מכן יעברו בדיקת ניתוח שונות (ANOVA) תוך שימוש בהליך MIXED של SAS. כל ההשוואות הזוגיות בין הקבוצות ייבחנו באמצעות התאמת טווח סטודנטיאלית של Tukey. ניתוח רב-משתני פרמוטציוני של שונות (PERMANOVA; מיושם בתוכנת Primer6) ישמש כדי לזהות הבדלים משמעותיים בין מדדי מגוון של קהילות מיקרוביאליות. השפע היחסי של OTUs הליבה שנבחר ייבדק עבור קשרים מובהקים סטטיסטית עם מטא נתונים זמינים באמצעות ניתוח רב-משתני עם מודלים ליניאריים (MaAsLin) [32] המהווים את כל המבלבלים הפוטנציאליים (משתנים משתנים) שיכולים להיות קשורים לפרופיל של המיקרוביום (כלומר מין, גיל, BMI) והמשתתפים (מטופלים כגורם אקראי). אסוציאציות משמעותיות ייחשבו מתחת לסף ערך של 0.1. כדי להעריך את השינויים בפונקציונליות של המיקרוביום, ניתוח רשת מתאם (CoNet, [33]) ישמש כדי לחקור קשרי התרחשות משותפת/הדרה הדדית של חיידקים ולזהות OTUs של רכזות המציגות את המספר הגבוה ביותר של מתאמים חיוביים/שליליים עם אחרים. OTUs בתנאי טיפול.
השפעות הטיפול על תוצאות ליניאריות בסוף כל תקופה ינותחו על ידי הליך SAS MIXED (SAS 9.4). רצף ומין ייכללו במודל כגורמים קבועים, והמשתתפים ייכללו כגורמים חוזרים. תקינות התפלגות הנתונים תיעשה באמצעות מבחן Shapiro-Wilk, והמשתנים הלא נורמליים יועברו לפני הניתוח. נתונים דמוגרפיים ידווחו כממוצע ± סטיית תקן. התוצאות ידווחו כממוצעים בריבוע הנמוכים ביותר ± שגיאת תקן של הממוצע (SEM), אלא אם צוין אחרת. מובהקות סטטיסטית תוגדר ל-p < 0.05 עבור כל הניתוחים. פלטפורמת מדעי הנתונים ב-CHI תספק תמיכה בניהול נתונים בנוסף לתמיכה בסטטיסטיקה של הפרויקט.
רנדומיזציה, עיוור ושבירת קוד
מטופלים מתאימים (n=36) יעברו הערכות בתחילת הדרך ויוקצו אקראית ל-2 קבוצות, שכל אחת תכלול 18 משתתפים. האקראי יעשה על ידי חוקר עצמאי בפלטפורמת הביוסטטיסטיקה במרכז ג'ורג' ופיי יי לחדשנות בריאות (CHI) באוניברסיטת מניטובה. האקראי יבוצע באמצעות קוד שנכתב בשפת התכנות הסטטיסטית R (גרסה 3.5.3). הטיפולים יוקצו ביחס של 1:1. בסך הכל יוכנו 48 כרטיסי רנדומיזציה, סט אחד של 24 לכל מין. לוח הזמנים האקראי יועבר לקבוצות של מעטפות סגורות אטומות. לאחר ביקור בסיס של המשתתף, צוות המחקר יפתח מעטפה סגורה שתכיל את ההקצאה של המשתתף. סדר ההתערבויות יהיה עיוור הן עבור החוקרים והן עבור המשתתפים. הטיפולים יינתנו בשקיות סגורות; תוכן שקיק יסווור על ידי גורם חיצוני, יינתן לצוות המחקר מסומן כ-A או B, ויחולק למשתתפים בהתאם לתקופת הטיפול שלהם. הטיפולים לא יבוטלו עד להשלמת הניתוחים, אלא אם כן הדבר נדרש עקב תופעות לוואי במהלך הניסוי הקליני. כמו כן, תתקיים סקירת נקודת אמצע של הנתונים הקליניים של המשתתף על ידי נפרולוג בלתי תלוי אשר לא יהיה עיוורון (ראה סעיף "אחריות חוקר מוסמך").
חישוב גודל לדוגמה
גודל דגימות סופי של 30 משתתפים במחקר זה יוכל לזהות הבדל בין הטיפולים בסך ה-p-cresol sulfate של 17.5 מיקרומול/ליטר, או שינוי של ~15 אחוז, בחזק של .88 (אלפא {{6} }.05, דו-צדדי), בהינתן מתאם בתוך אדם של .79 [23] וסטיית תקן משוערת של 45 מיקרומול/ליטר [9] עבור סך p-cresol sulfate. ירידה של 30 אחוזים או יותר במומסים אורמיים תיחשב משמעותית מבחינה קלינית, מה שמצדיק ניסויים נוספים החוקרים התערבות פרה-ביוטית זו ב-CKD, ואנו בטוחים שנוכל לזהות שינוי כזה אם יתרחש. כדי לתת את הדעת על אובדן הכוח עקב נשירה, נגייס 36 משתתפים.
הכללה בניתוח
הניתוח העיקרי יתבצע באמצעות ערכת הניתוח של כל המשתתפים (הכוונה לטיפול). הניתוח הראשוני יחזור על עצמו בערכת הניתוח של Completers. הדמוגרפיה וכל יתר המדידות הבסיסיות ינותחו בערכת כל המשתתפים וכן בערכת השלימים.
ערכת ניתוח משלימים: כל המשתתפים שסיימו את הניסוי.
ערכת ניתוח כל המשתתפים: כל המשתתפים באקראי.
הפסקה/הסרה של משתתפים מטיפול ניסוי
לכל משתתף הזכות לפרוש מהניסוי בכל עת. המשתתפים רשאים להפסיק את ההשתתפות בניסוי בכל עת ומתבקשים ליצור קשר עם חבר צוות מחקר כדי ליידע אותם על החלטתם. כמו כן, החוקרים רשאים להפסיק משתתף מהניסוי בכל עת אם החוקרים רואים בכך צורך מכל סיבה שהיא לרבות הריון, אי-כשירות (בין אם נוצר במהלך הניסוי או בדיעבד לאחר שהתעלמו במיון), חריגה משמעותית בפרוטוקול, אי-כשירות משמעותית. עמידה בפרוטוקול, התקדמות מחלה הגורמת לחוסר יכולת להמשיך ולעמוד בפרוטוקול, ביטול הסכמה ואובדן מעקב.

נסיגה לא תגרום להחרגת הנתונים של אותו משתתף מהניתוח. מכיוון שהניתוח הראשוני יתבסס על כוונה לטיפול, יתבצע גם ניתוח מלא יותר בלבד.
אם משתתף יפרוש במהלך 4 השבועות הראשונים של הניסיון, הם יוחלפו. אם המשתתף המחליף יפרוש, לא תהיה החלפה לאחר מכן.
סיבת הנסיגה תירשם ב-CRF אם תסופק.
שָׂכָר
המשתתפים יקבלו תגמול של $200 עבור כל תקופה שהושלמה או הערך היחסי אם יפרושו מהניסוי. כל משתתף יקבל 400 דולר בסך הכל אם ישלים את הניסיון המלא.
השמות והכתובות של המשתתפים ישמשו להכנה, הדפסה, דיוור ושמירת רישומים פיננסיים או המחאות תגמול. דמי משלוח בתשלום מראש ומעטפה יסופקו למשתתף עם טופס המחייב את חתימתו עם קבלת המחאת התגמול. המשתתפים יתבקשו להחזיר את הטופס ל-CDIC. רישום זה יישמר לכל היותר 7 שנים.
דִיוּן
CKD נקשר לשינויים באקולוגיה המיקרוביאלית של המעי, או "דיסביוזיס", אשר עשוי לתרום להתקדמות המחלה. אנשים ובעלי חיים עם CKD מפגינים שינויים עמוקים בסביבת המעי, כולל שינויים בהרכב החיידקים, עלייה ב-pH צואה, ועלייה ברמות הדם של מטבוליטים שמקורם בחיידקים במעיים. מחקרים אחרונים התמקדו בגישות תזונתיות לשינוי חיובי בהרכב הקהילות החיידקיות במעיים כשיטת טיפול ב-CKD. עמילן עמיד (RS), פרה-ביוטיקה המקדמת שגשוג של חיידקי מעיים כגון ביפידובקטריה ולקטובצילים, מגביר את הייצור של מטבוליטים כולל חומצות שומן קצרות שרשרת, המעניקות מספר יתרונות בריאותיים. מחקרים ממודלים של בעלי חיים ואנשים עם CKD מראים שתוסף RS מחליש את הריכוזים של מומסים לשמירה אורמית, כולל אינדוקסיל סולפט ו-p-cresol sulfate. הוכח כי עמילן עמיד בתירס מסוג 2 (HAMRS2) עמיד בסיבים תזונתיים עתירי סיבים תזונתיים, הוכח כמשנה את סביבת המעיים במודלים של חולדות CKD המוביל לשיפור ניכר בתפקוד הכליות. RPS, שהוא עמילן עמיד ל-R2-, הוכח כמגביר חיידקים מפרקי פחמימות, כגון Bifidobacteria, ומפחית חיידקים עם פעילות פרוטאוליטית, כגון E. coli [14, 17, 18]. כמו כן, הוכח כי RPS מפחית את הריכוזים של רעלנים אורמיים שמקורם במיקרוביום במעי בחזירים [19]. בעוד שמחקרים בבעלי חיים ובבני אדם הכוללים עמילן עמיד הראו את היכולת לשנות את המיקרוביוטה של המעי ולהפחית את מספר הרעלים האורמיים, ישנם מחקרים מוגבלים בחולים עם CKD [14].
במחקר אחד שנערך על אנשים עם CKD שכבר עברו דיאליזה, נצפתה הפחתה ברעלים אורמיים בעקבות צריכת עמילוז תירס גבוהה של עמילוז במשך 6 שבועות [20]. עמילן תירס עתיר עמילוז הוא ~ 60 אחוז עמילן עמיד לפי משקל יבש, בעוד שה-RPS שישמש בהצעה זו הוא ~ 70 אחוז עמילן עמיד ו~10 אחוז סיבים תזונתיים אחרים [17]. כאן, נערוך ניסוי מוצלב כפול סמיות אקראי לתקופה של 2- כדי לבדוק אם צריכת RPS כטיפול משלים לסטנדרטים הנוכחיים של טיפול ב-CKD תפחית רעלים ותסמינים אורמיים על ידי שינוי המיקרוביוטה של המעיים בחולים עם CKD.
תוצאות מחקר זה יוסיפו להוכחות ליעילות של RPS בחולים עם CKD ויהוו בסיס לניסוי רב-מרכזי אקראי מבוקר גדול יותר שיבדוק את השפעת RPS על עיכוב התקדמות CKD והתחלת דיאליזה.
ניהול נתונים
מקור מידע
מסמכי מקור הם המקום שבו הנתונים נרשמים לראשונה וממנו מתקבלים נתוני ה-CRF של המשתתפים. ערכי CRF ייחשבו לנתוני מקור אם ה-CRF הוא האתר של ההקלטה המקורית (למשל, אין רישום כתוב או אלקטרוני אחר של נתונים). כל המסמכים יאוחסנו בבטחה בתנאים חסויים. בכל המסמכים הספציפיים לניסוי, מלבד טפסי ההסכמה החתומים, רשימת האב וטפסי התגמול, המשתתף יופנה באמצעות קוד משתתף הניסיון, לא בשמו.
גישה לנתונים
גישה ישירה תינתן לנציגים מורשים מהספונסר, המוסד המארח והרשויות הרגולטוריות כדי לאפשר ניטור, ביקורת ובדיקות הקשורות לניסוי.
רישום נתונים ושמירת רישומים
כל נתוני הניסוי יוזנו מ-CRF נייר או ייאספו דרך פלטפורמת REDCap של אוניברסיטת מניטובה, ומסמכי מקור אחרים יוזנו למסד הנתונים של REDCap זה. המשתתפים יזוהו באמצעות מספר ו/או קוד ייחודיים לניסוי במסד הנתונים של REDCap זה. שם המשתתף וכל מידע מזהה אחר לא ייכללו במסד הנתונים של REDCap, למעט טופס ההסכמה מדעת החתום, טופס התגמול ורשימת המאסטר ללימודים. כתובות הבית וכתובות הדוא"ל ומספרי הטלפון של המשתתף יאספו ויקושרו לתעודת זהות המחקר ולשם המשתתף ברשימת מאסטר לימודים פיזית/אלקטרונית שתשמש לתיאום פעילויות ניסיון כגון משלוחים הביתה של חומרי הלימוד, המחאות תגמול ותקשורת עם המשתתפים במהלך הניסוי. רשימת מאסטר זו תישמר בארון נעול ב-CDIC או בכונן/מחשב משותף המוגן בסיסמה ב-CDIC. שמות המשתתפים וכתובתם ישותפו עם צוות המשלוחים או השליחים במהלך תהליך המשלוח, וכן ישמשו למשלוח המחאות תגמול עבור המשתתפים שלא יאספו באופן אישי.
נתוני ניסוי, ללא זיהוי מידע אישי של המשתתפים, יאוחסנו בסביבת מחקר מאובטחת באוניברסיטת מניטובה באמצעות REDCap. REDCap מיושם באופן מקומי על ידי פלטפורמת Data Science במרכז George & Fay Yee לחדשנות בריאות באוניברסיטת מניטובה. ביקורים וירטואליים לימודיים יתבצעו באמצעות פלטפורמת Microsoft Teams של אוניברסיטת מניטובה, שהיא שירות מבוסס ענן שמתארח חיצונית. נתונים אלקטרוניים עם פרטים אישיים מזהים של משתתף, כגון שם ופרטי איש קשר, יוגנו בסיסמה ויישמרו בקובץ אקסל במחשב ב-CDIC. רשומות אלקטרוניות של טפסי הסכמה חתומים יישמרו ב-REDCap, וכן יאוחסנו במחשב מאובטח/כונן משותף המוגן בסיסמה ב-CDIC או בארון נעול. טפסי הסכמה חתומים על נייר יאוחסנו בארון נעול ב-CDIC. יומני לימוד אחרים יאורגנו בקלסר יציב ויישמרו ב-CDIC. CDIC מאובטח 24 שעות ביממה ויש לו גישה מוגבלת.
כל רישומי מחקר הניסוי יישמרו למשך 25 שנה. CRFs נייר ונתוני מקור יישמרו במיכל אחסון נעול, מלבד כל מידע מזהה אישי ב-CDIC. קבצי נייר יסולקו באמצעות שיטת השמדת המסמכים הסודיים ב-CDIC.

נתונים אלקטרוניים יבוטלו ויישמרו למשך 10 שנים לאחר סיום המחקר. נתונים אלקטרוניים עשויים להיות משותפים גם בצורה לא מזוהה עם כתבי עת אקדמיים למטרות פרסום. הנתונים עשויים להיות מאוחסנים על ידי כתב העת האקדמי או מאגרי גישה פתוחים אחרים במסגרת מדיניות גישה פתוחה, ובמקרה זה הם עשויים לשמש חוקרים אחרים להמשך ניתוח נתונים וצורכי מחקר. קבצי נייר יסולקו בשיטת השמדת מסמכים סודיים.
קריטריונים לסיום המשפט
הניסוי יימשך עד שכל המשתתפים שגויסו יגיעו לסוף המעקב והנתונים ייאספו, יעובדו וינוקו. אין תוכניות לסיום מוקדם.
נוהל התחשבות בנתונים חסרים, שאינם בשימוש ומזויפים
מספר ושיעור הערכים החסרים יתועדו בדוח המחקר הקליני. ערכים חסרים לא ייזקפו אלא אם צוין אחרת. ניתוחים לא יכללו נתונים ממשתתפים שיש להם ערכים חסרים עבור כל משתנה הנדרש לניתוח.
כאשר הנתונים מתגלים כיוצאי דופן באופן שלא ניתן להסביר או לקבוע שהם שגויים, ניתן לחזור על ניתוחים לאחר אי הכללת הרשומה המעורבת. ניתוחים נוספים אלו יוצגו כניתוחי רגישות.
נהלים לדיווח על כל חריגה מהתכנית הסטטיסטית המקורית
כל חריגות הפרוטוקול המתועדות במסד הנתונים של הניסויים הקליניים יפורטו בטבלה (במידת הצורך) וירשמו בדוח המחקר הקליני.
רישום תופעות לוואי
בהתחשב באופי ההתערבות, לא סביר מאוד שאירועים לוואי יהיו קשורים לניסוי. עם זאת, כל ההפרעות המתרחשות במהלך הניסוי שנצפו על ידי החוקרים או מדווחות על ידי המשתתף יתועדו ב-CRF, בין אם מיוחסות להתערבות הניסוי ובין אם לאו.
המידע הבא יירשם: תיאור, תאריך התחלה ותאריך סיום, חומרה והערכת הקשר להתערבות בניסוי. יש לספק מידע מעקב לפי הצורך. במקרה של דיווח על אירוע לוואי כלשהו, יוצעו למטופלים להיראות בביקור הזמין הבא במרפאה או תוך שבוע אחד, המוקדם מביניהם, וימשיכו לעקוב במרפאה עד לפתרון ההפרעה.
חומרת האירועים תוערך בסולם הבא: 1=קל, 2=בינוני ו-3=חמור.
תופעות לוואי שנחשבות קשורות להתערבות בניסוי כפי ששופטו על ידי החוקר המוסמך ייבדקו עד לפתרון או שהאירוע ייחשב יציב. במקרה של תופעות לוואי גורמות לנסיגה מהניסוי, המטופלים שיבוטלו עקב תגובה שלילית בטיפול יעקוב גם אחר מרפאת CKD עד שהתופעות לוואי ייפתרו.
דיווח בטיחות
צוות המחקר ידווח על תופעות לוואי לבריאות קנדה ולראשי המחלקות/המוסדות הרלוונטיים ולאוניברסיטת מניטובה REB באמצעות טפסי דיווח מתאימים.
נהלי אבטחת איכות
הניסוי יתנהל לפי הפרוטוקול המאושר כעת, GCP, תקנות רלוונטיות ונהלי הפעלה סטנדרטיים.
ניתן לבצע ניטור קבוע בהתאם ל-GCP. ניתן להעריך נתונים על עמידה בפרוטוקול ובדיוק של מסמכי המקור. בעקבות נהלי הפעלה סטנדרטיים כתובים, המוניטורים יאמתו שהניסוי הקליני נערך והנתונים נוצרים, מתועדים ומדווחים בהתאם לפרוטוקול, ל-GCP ולדרישות הרגולטוריות החלות.
קיצורי מילים
AE: אירוע לוואי; AR: תגובה שלילית; PI: חוקר ראשי; CRA: עמית מחקר קליני; CRF: טופס דיווח מקרה; GCP: תרגול קליני טוב; CT: ניסויים קליניים; ICF: טופס הסכמה מדעת; REB: מועצת אתיקה מחקרית; SAE: אירוע לוואי חמור; SOP: נוהל הפעלה סטנדרטי
תודות
ברצוננו להודות ולהודות למישל דינלה, שרה קרטיס וצוות ה-CDIC על התמיכה בהקמת ניסוי זה.
הצהרת הלסינקי
החוקר/QI יוודא שמשפט זה יתנהל על פי עקרונות הצהרת הלסינקי. NB. הצהרת הלסינקי משנת 2008 מספקת פירוט על מה שיש לכלול בפרוטוקול: מימון, חסות, השתייכות וניגודי עניינים פוטנציאליים, תמריצים להשתתפות, פיצוי על נזק וגישה לאחר ניסוי לתרופות וטיפול.
דיווח
החוקר/QI יגיש אחת לשנה במהלך הניסוי הקליני דו"ח התקדמות שנתי למועצת האתיקה לחקר הבריאות של אוניברסיטת מניטובה. בנוסף, הודעה על סיום הניסוי תוגש למועצת האתיקה לחקר הבריאות של אוניברסיטת מניטובה ולבריאות קנדה.
חיסיון המשתתפים
צוות הניסוי ידאג לשמור על אנונימיות המשתתפים. המשתתפים יזוהו רק על ידי מספר זהות של משתתף בכל מסמכי הניסיון ובכל מאגר מידע אלקטרוני למעט טופס ההסכמה מדעת, רשימת האב וטופס התגמול. כל המסמכים יאוחסנו בצורה מאובטחת ונגישים רק על ידי צוות הניסיון וצוות מורשה. הניסוי יעמוד בחוק מידע הבריאות האישי (PHIA) או חוק חופש המידע והגנת הפרטיות (FIPPA) של מניטובה.
מצב משפט
ניסוי זה צפוי להתחיל בגיוס בספטמבר 2021 ולהימשך עד מרץ 2022 לערך. מספר הפרוטוקול והתאריך הנוכחיים הם גרסה 3, 13 ביוני 2021.

הרכב, תפקידים ואחריות של מרכז התיאום
ה-PI (ד"ר מקאי) והחוקרים המשותפים (ד"ר טנגרי ומולארד) יהיו אחראים על הפיקוח. סטודנט לדוקטורט ורכז מחקר יעבדו יחד על הניהול היומיומי של הניסוי כולל גיוס, מיון, תזמון, ביקורי משתתפים, איסוף נתונים והזנת נתונים. הדוקטורט הסטודנט ידווח ישירות ל-PI (ד"ר מקאי), ורכז המחקר יהיה בקשר יומיומי עם החוקר השותף המפקח עליהם (ד"ר מולארד). מנתח נתונים יהיה אחראי על ניתוח הנתונים בפיקוח ד"ר. מאקי וטנגרי. הפרויקט יידון עם צוות המחקר הכולל של CDIC במהלך מפגש קבוצתי קליני כל שבועיים ובמהלך פגישות דו-שבועיות עם צוות המחקר של הפרויקט כדי לדון בפרטי פרויקט ספציפיים.
תרומות מחברים
MS סייעה בניסוח כתב היד ובאיסוף משוב ושינויים מחברים אחרים. ק.ק. סייעה בסקירת כתב היד. HW ביקש אישור אתי ותרם לכתב היד. RM, NT ו-DM עיצבו את פרוטוקול המחקר וקריטריוני הבחירה של המשתתפים, ביקשו מימון ואישור אתי, סייעו בתיקונים של כתבי היד וסקרו את כתב היד. כל המחברים תרמו, קראו, ערכו תיקונים קריטיים ואישרו את כתב היד הסופי לפני ההגשה.
מימון
ניסוי זה ממומן על ידי יוזמת משפחת ווסטון למיקרוביום ומרכז החדשנות למחלות כרוניות בבית החולים Seven Oaks. מוצרי הטיפול המשמשים בניסוי זה מסופקים על ידי MSPrebiotic Inc. ללא תשלום. למממנים לא תהיה כל מעורבות בתכנון הניסוי, הביצוע, ניתוח הנתונים או הפרסום. נותנת החסות לניסוי היא אוניברסיטת מניטובה, שדילן מקיי הוא איש הקשר שלה.
זמינות נתונים וחומרים
הפרסומים הנובעים מניסוי זה יפעלו בהתאם להמלצות ICMJE למחבר. תוצאות ניסוי זה יפורסמו בפרסום בעל ביקורת עמיתים וייתכן שיוצגו בכנסים. תוצאות הסיכום של מחקר זה יועלו לרישום ClinicalTrials.gov של הניסוי. נתונים לא מזוהים יהיו זמינים לחוקרים אחרים לפעילויות סינתזת ידע לפי בקשה סבירה.
הצהרות
אישור אתיקה והסכמה להשתתפות
מועצת האתיקה הביו-רפואית של Bannatyne Campus (BREB) בוויניפג, מניטובה, קנדה, אישרה פרוטוקול מחקר זה (HS23161 (B2019:089). כל התיקונים לפרוטוקול של מחקר זה נבדקים ומאושרים על ידי U of M BREB, ושינויים ב הפרוטוקול מעודכן ב-ClinicalTrials.gov. Health Canada פרסמה את הודעת ההרשאה לניסוי זה (תיק מס' 250522). על המשתתפים לחתום באופן אישי ולתאריך את הגרסה המאושרת העדכנית ביותר של טופס ההסכמה מדעת לפני ביצוע הליכים ספציפיים לניסוי ניסוי זה רשום ב-ClinicalTrials.gov (NCT04961164).
הסכמה לפרסום
כל המשתתפים יספקו הסכמה לפרסם או להציג את המידע שנאסף במהלך המשפט באופן שבו הפרטים המזהים שלהם כגון שמם, כתובתם ומספר הטלפון שלהם אינם נחשפים.
אינטרסים מתחרים
כל שאר המחברים מצהירים שאין להם אינטרסים מתחרים.
פרטי מחבר
1 מרכז חדשנות למחלות כרוניות, Seven Oaks General Hospital, Winnipeg, MB, קנדה. 2 המחלקה למדעי התזונה האנושית, אוניברסיטת מניטובה, וויניפג, MB, קנדה. 3 המחלקה למדעי בריאות הקהילה, אוניברסיטת מניטובה, וויניפג, MB, קנדה. 4 מכללת מקס ראדי לרפואה, אוניברסיטת מניטובה, וויניפג, MB, קנדה.
הפניות
1. Arora P, Vasa P, Brenner D, Iglar K, McFarlane P, Morrison H, et al. הערכות שכיחות של מחלת כליות כרונית בקנדה: תוצאות של סקר מייצג ארצי. CMAJ. 2013;185(9):E417–23.
2. Ng JK, Li PK. מגפת מחלת כליות כרונית: איך מתמודדים איתה? נפרולוגיה (קרלטון). 2018;23(נספח 4):116–20. PMID: 30298662.
3. Fujii H, Kono K, Nishi S. מאפיינים של מחלת עורקים כליליים במחלת כליות כרונית. Clin Exp Nephrol. 2019;23(6):725–32.
4. Collister D, Ferguson T, Komenda P, Tangri N. הדפוסים, גורמי הסיכון והניבוי של התקדמות במחלת כליות כרונית: סקירה נרטיבית. סמינ נפרול. 2016;36(4):273–82. PMID: 27475658.
5. Beaudry A, Ferguson TW, Rigatto C, Tangri N, Dumanski S, Komenda P. עלות טיפול בדיאליזה לפי שיטות במניטובה. כתב עת קליני של האגודה האמריקאית לנפרולוגיה. 2018;13(8):1197–203. PMID: 30021819.
6. Aronov PA, Luo FJG, Plummer NS, Quan Z, Holmes S, Hostetter TH, et al. תרומה של המעי הגס למומסים אורמיים. J Am Soc Nephrol. 2011;22(9):1769– 76. PMID: 21784895.
7. Ramezani A, Massy ZA, Meijers B, Evenepoel P, Vanholder R, Raj DS. תפקיד המיקרוביום של המעי באורמיה: יעד טיפולי פוטנציאלי. כתב העת האמריקאי למחלות כליה. 2016;67(3):483–98. PMID: 26590448.
8. Simonsen E, Komenda P, Lerner B, Askin N, Bohm C, Shaw J, et al. טיפול בגרד אורמי: סקירה שיטתית. Am J Kidney Dis. 2017; 70(5):638–55. PMID: 28720208.
9. Meijers BK, et al. P-Cresol וסיכון קרדיווסקולרי במחלת כליות קלה עד בינונית. Clin J Am Soc Nephrol. 2010;5(7):1182–9. PMID: 20430946.
10. Gao H, Liu S. תפקידו של הרעלן האורמי אינדוקסיל סולפט בהתקדמות של מחלות לב וכלי דם. מדעי החיים. 2017;185:23–9. PMID: 28754616.
11. Lisowska-Myjak B. Toxins Uremic והשפעותיהם על מערכות איברים מרובות. Nephron Clin Practic. 2014;128(3-4):303–11. PMID: 25531673.
12. שולמן G, Berl T, Beck GJ, Remuzzi G, Ritz E, Arita K, et al. ניסויי EPPIC אקראיים מבוקרי פלצבו של AST-120 ב-CKD. J Am Soc Nephrol. 2015; 26(7):1732–46. PMID: 25349205.
13. Hung SC, Kuo KL, Wu CC, Tarng DC. אינדוקסיל סולפט: גורם סיכון קרדיווסקולרי חדש במחלת כליות כרונית. כתב העת של איגוד הלב האמריקאי. 2017;6(2):e005022. PMID: 28174171.
14. Snelson M, Kellow NJ, Coughlan MT. מודולציה של מיקרוביוטת המעי על ידי עמילן עמיד כטיפול במחלות כליה כרוניות: עדות ליעילות ותובנות מכניסטיות. עו"ד נוטר. 2019;10(2):303–20. PMID: 30668615.
15. Birkett A, Muir J, Phillips J, Jones G, O'Dea K. עמילן עמיד מוריד ריכוזי צואה של אמוניה ופנולים בבני אדם. Am J Clin Nutr. 1996; 63(5):766–72. PMID: 8615362.
16. Smith EA, Macfarlane GT. ספירת חיידקי המעי הגס אנושיים המייצרים תרכובות פנוליות ואינדוליות: השפעות של pH, זמינות פחמימות וזמן שמירה על חילוף החומרים של חומצות אמינו ארומטיות. J Appl Bacteriol. 1996;81(3):288–302. PMID: 8810056.
17. Alfa MJ, Strang D, Tappia PS, Graham M, van Domselaar G, Forbes JD, et al. ניסוי אקראי לקביעת ההשפעה של הרכב עמילן עמיד לעיכול על מיקרוביום המעי במבוגרים מבוגרים ובני גיל. קלין נוטר. 2018;37(3):797–807.
18. Baxter NT, Schmidt AW, Venkataraman A, Kim KS, Waldron C, Schmidt TM, et al. דינמיקה של מיקרוביוטה של המעי האנושי וחומצות שומן קצרות שרשרת בתגובה להתערבויות תזונתיות עם שלושה סיבים מתסיסים. MBio. 2019. PMID: 30696735;10(1):e02566–18.
19. Losel D, Claus R. השפעות תלויות מינון של עמילן תפוחי אדמה עמיד בתזונה על היווצרות skatole של המעי והצטברות רקמת שומן בחזיר. J Vet Med A Physiol Pathol Clin Med. 2005;52(5):209–12. PMID: 15943603.
20. Sirich TL, Plummer NS, Gardner CD, Hostetter TH, Meyer TW. השפעת הגדלת סיבים תזונתיים על רמות הפלזמה של מומסים שמקורם במעי הגס בחולי המודיאליזה. Clin J Am Soc Nephrol. 2014;9(9):1603–10. PMID: 25147155.
21. Pretorius CJ, McWhinney BC, Sipinkoski B, Johnson LA, Rossi M, Campbell KL, et al. טווחי התייחסות ושונות ביולוגית של אינדוקסיל ו-p-cresyl סולפט בסרום חופשי וסרום נמדד בשיטת זיהוי קרינה מהירה UPLC. Clin Chim Acta. 2013;419:122–6. PMID: 23428591.
22. Magoc T, Salzberg SL. FLASH: התאמת אורך מהירה של קריאות קצרות לשיפור מכלול הגנום. ביואינפורמטיקה. 2011;27(21):2957–63. PMID: 21903629.
23. אדגר RC. UPARSE: רצפי OTU מדויקים ביותר מקריאות אמפליקון מיקרוביאליות. שיטות נאט. 2013;10(10):996–8. PMID: 23955772.
24. אדגר RC. חיפוש וקיבוץ סדרי גודל מהר יותר מ-BLAST. ביואינפורמטיקה. 2010;26(19):2460–1. PMID: 20709691.
25. Caporaso JG, Bittinger K, Bushman FD, DeSantis TZ, Andersen GL, Knight R. PyNAST: כלי גמיש ליישור רצפים ליישור תבנית. ביואינפורמטיקה. 2010;26(2):266–7. PMID: 19914921.
26. Caporaso JG, Kuczynski J, Stombaugh J, Bittinger K, Bushman FD, Costello EK, et al. QIIME מאפשר ניתוח של נתוני רצף קהילה בעלי תפוקה גבוהה. שיטות נאט. 2010;7(5):335–6. PMID: 20383131.
27. Price MN, Dehal PS, Arkin AP. FastTree 2 - עצים בעלי סבירות מקסימלית עבור יישורים גדולים. PLOS ONE. 2010;5(3):e9490. PMID: 20224823.
28. Paulson JN, Stine OC, Bravo HC, Pop M. ניתוח שפע דיפרנציאלי עבור סקרי גנים מיקרוביאליים. שיטות טבע. 2013;10(12):1200. PMID: 24076764–2.
29. Jari Oksanen FGB, Friendly M, Kindt R, Legendre P, McGlinn D, Minchin PR, et al. החבילה הטבעונית, בחבילת אקולוגיה קהילתית; 2019.
30. גלילי טי. dendextend: חבילת R להדמיה, התאמה והשוואה של עצים של מקבץ היררכי. ביואינפורמטיקה. 2015;31(22):3718–20. PMID: 26209431.
31. Gu Z, Eils R, Schlesner M. מפות חום מורכבות חושפות דפוסים ומתאמים בנתונים גנומיים רב-ממדיים. ביואינפורמטיקה. 2016;32(18): 2847–9. PMID: 27207943.
32. Morgan XC, Tickle TL, Sokol H, Gevers D, Devaney KL, Ward DV, et al. תפקוד לקוי של המיקרוביום של המעי במחלות מעי דלקתיות וטיפול. גנום ביול. 2012;13(9):R79. PMID: 23013615.
33. Faust K, Sathirapongsasuti JF, Izard J, Segata N, Gevers D, Raes J, et al. קשרי התרחשות מיקרוביאלית במיקרוביום האנושי. PLoS Comput Biol. 2012;8(7):e1002606. PMID: 22807668
הערת המוציא לאורSpringer Nature נשאר ניטרלי בכל הנוגע לתביעות שיפוט במפות שפורסמו ובשיוכים מוסדיים.
【למידע נוסף: david.deng@wecistanche.com / WhatApp:86 13632399501】






